Protein–RNA interactions for Protein: Q12324

YVC1, Calcium channel YVC1, yeastyeast

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YVC1Q12324 PDR1YGL013C 3207 nt2.44□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 OST4YDL232W 111 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 CMC4YMR194C-B 222 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 RPS30BYOR182C 192 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 PTP2YOR208W 2253 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 ENV11YGR071C 2583 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 DGR2YKL121W 2559 nt2.43□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 STE11YLR362W 2154 nt2.42□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 ATG11YPR049C 3537 nt2.42□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 AMS1YGL156W 3252 nt2.42□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.41□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 SMC6YLR383W 3345 nt2.41□□□□□ -2.02
YVC1Q12324 YBR206WYBR206W 324 nt2.4□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 PDR11YIL013C 4236 nt2.4□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 APL2YKL135C 2181 nt2.4□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.39□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 PHO91YNR013C 2685 nt2.39□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 IRA2YOL081W 9240 nt2.38□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 UBP2YOR124C 3819 nt2.38□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.38□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 YPP1YGR198W 2454 nt2.37□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 YOR019WYOR019W 2193 nt2.37□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 TIM9YEL020W-A 264 nt2.37□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 COX12YLR038C 252 nt2.37□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 MAK10YEL053C 2202 nt2.37□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 NAB6YML117W 3405 nt2.36□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 IFH1YLR223C 3258 nt2.36□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 YNL018CYNL018C 1839 nt2.36□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 SLN1YIL147C 3663 nt2.35□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 PRP5YBR237W 2550 nt2.35□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 SAP190YKR028W 3102 nt2.35□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 SOM1YEL059C-A 225 nt2.35□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.35□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.35□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 YDR521WYDR521W 336 nt2.34□□□□□ -2.03
YVC1Q12324 ALK1YGL021W 2283 nt2.34□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 YDL118WYDL118W 381 nt2.33□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 MLH3YPL164C 2148 nt2.33□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 SCD5YOR329C 2619 nt2.33□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 DNF1YER166W 4716 nt2.33□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 AGC1YPR021C 2709 nt2.33□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 MSB1YOR188W 3414 nt2.32□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 NEO1YIL048W 3456 nt2.32□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.32□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 VPS8YAL002W 3825 nt2.32□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.31□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 CHS6YJL099W 2241 nt2.31□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 MET18YIL128W 3099 nt2.31□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 SSD1YDR293C 3753 nt2.3□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 TTI1YKL033W 3117 nt2.3□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 YPR097WYPR097W 3222 nt2.3□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.3□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 SPP41YDR464W 4308 nt2.3□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 TOR1YJR066W 7413 nt2.29□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 UBR1YGR184C 5853 nt2.29□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 MSH5YDL154W 2706 nt2.29□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 HMI1YOL095C 2121 nt2.28□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 NUP100YKL068W 2880 nt2.28□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 YLL054CYLL054C 2532 nt2.28□□□□□ -2.04
YVC1Q12324 PKH2YOL100W 3246 nt2.27□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 STF2YGR008C 255 nt2.26□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 REV3YPL167C 4515 nt2.26□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 BUD2YKL092C 3315 nt2.26□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.26□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 YNL144CYNL144C 2223 nt2.26□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.25□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 APL1YJR005W 2103 nt2.25□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 TFC3YAL001C 3483 nt2.24□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 SAP185YJL098W 3177 nt2.24□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 YGL182CYGL182C 324 nt2.23□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 COG4YPR105C 2586 nt2.23□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.23□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.22□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 CHC1YGL206C 4962 nt2.21□□□□□ -2.05
YVC1Q12324 UBP1YDL122W 2430 nt2.21□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 SCP160YJL080C 3669 nt2.21□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 USO1YDL058W 5373 nt2.21□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 SLI15YBR156C 2097 nt2.21□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 LHS1YKL073W 2646 nt2.21□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 TRL1YJL087C 2484 nt2.2□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 CTR9YOL145C 3234 nt2.2□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.2□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 FKS1YLR342W 5631 nt2.19□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 QCR9YGR183C 201 nt2.19□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.19□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 GIP3YPL137C 3831 nt2.19□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 CDC60YPL160W 3273 nt2.18□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 GCN2YDR283C 4980 nt2.18□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.18□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 UTP8YGR128C 2142 nt2.18□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 TUS1YLR425W 3924 nt2.18□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 SYH1YPL105C 2550 nt2.17□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.17□□□□□ -2.06
YVC1Q12324 TOR2YKL203C 7425 nt2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.9 ms