Protein–RNA interactions for Protein: Q08054

CSI2, Chitin synthase 3 complex protein CSI2, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2Q08054 YOL160WYOL160W 342 nt0.63□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YCK3YER123W 1575 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YDL206WYDL206W 2289 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YPL185WYPL185W 396 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 PRM3YPL192C 402 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YCS4YLR272C 3531 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 ALY2YJL084C 3141 nt0.62□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 NHP2YDL208W 471 nt0.61□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.61□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YNL058CYNL058C 951 nt0.61□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YPL261CYPL261C 309 nt0.61□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 WAR1YML076C 2835 nt0.61□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 PKH2YOL100W 3246 nt0.61□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YMR160WYMR160W 2451 nt0.61□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 INP2YMR163C 2118 nt0.61□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 RAD34YDR314C 2079 nt0.6□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.6□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 GEA2YEL022W 4380 nt0.59□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YDR521WYDR521W 336 nt0.59□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 AGA2YGL032C 264 nt0.59□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 GPG1YGL121C 381 nt0.59□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YGR042WYGR042W 816 nt0.59□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.59□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 VPS20YMR077C 666 nt0.59□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 CMC4YMR194C-B 222 nt0.59□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 YNL324WYNL324W 396 nt0.59□□□□□ -2.31
CSI2Q08054 NUP157YER105C 4176 nt0.59□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 RIM20YOR275C 1986 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 SWF1YDR126W 1011 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YER079WYER079W 633 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 RPS20YHL015W 366 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.58□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 ATG31YDR022C 591 nt0.57□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 MAM33YIL070C 801 nt0.57□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.57□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YOL014WYOL014W 375 nt0.57□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 UTP20YBL004W 7482 nt0.57□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 CUL3YGR003W 2235 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YDL196WYDL196W 330 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 RPL38YLR325C 237 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YBR285WYBR285W 435 nt0.56□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YIR044CYIR044C 186 nt0.55□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.55□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 PAN2YGL094C 3348 nt0.54□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YDR426CYDR426C 378 nt0.54□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YJR011CYJR011C 786 nt0.54□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 BSC3YLR465C 309 nt0.54□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YOR053WYOR053W 342 nt0.54□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.54□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YLL007CYLL007C 1998 nt0.53□□□□□ -2.32
CSI2Q08054 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.52□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YHR138CYHR138C 345 nt0.52□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt0.52□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.52□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 IES4YOR189W 351 nt0.52□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 LEE1YPL054W 906 nt0.52□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 RKR1YMR247C 4689 nt0.52□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 PTP2YOR208W 2253 nt0.52□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 NIP100YPL174C 2607 nt0.51□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 ALG13YGL047W 609 nt0.51□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YHL042WYHL042W 453 nt0.51□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 PCC1YKR095W-A 267 nt0.51□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 DBP6YNR038W 1890 nt0.51□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YBR064WYBR064W 429 nt0.51□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YBR206WYBR206W 324 nt0.51□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 CSN9YDR179C 489 nt0.5□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YDR344CYDR344C 444 nt0.5□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 ISD11YER048W-A 285 nt0.49□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YOR121CYOR121C 306 nt0.49□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 BFR2YDR299W 1605 nt0.49□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 OLI1Q0130 231 nt0.48□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YOR218CYOR218C 420 nt0.48□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt0.48□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 VAR1Q0140 1197 nt0.47□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 ECM12YHR021W-A 456 nt0.47□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt0.47□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt0.47□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 MCM10YIL150C 1716 nt0.47□□□□□ -2.33
CSI2Q08054 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.46□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 YAR029WYAR029W 225 nt0.46□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 YAR053WYAR053W 297 nt0.46□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 YOR282WYOR282W 321 nt0.46□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 YPL044CYPL044C 549 nt0.46□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 TRS65YGR166W 1683 nt0.46□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 PMP1YCR024C-A 123 nt0.45□□□□□ -2.34
CSI2Q08054 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.1 ms