Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB1P53618 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB1P53618 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB1P53618 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB1P53618 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB1P53618 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB1P53618 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB1P53618 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COPB1P53618 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COPB1P53618 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPB1P53618 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB1P53618 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB1P53618 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB1P53618 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB1P53618 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB1P53618 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB1P53618 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB1P53618 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB1P53618 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB1P53618 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPB1P53618 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPB1P53618 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB1P53618 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB1P53618 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB1P53618 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB1P53618 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB1P53618 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB1P53618 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB1P53618 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPB1P53618 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms