Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHKA1P46020 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHKA1P46020 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms