Protein–RNA interactions for Protein: P27692

SPT5, Transcription elongation factor SPT5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT5P27692 YPL150WYPL150W 2706 nt2.84□□□□□ -1.95
SPT5P27692 snR70snR70 164 nt2.84□□□□□ -1.95
SPT5P27692 GIP3YPL137C 3831 nt2.84□□□□□ -1.95
SPT5P27692 OST4YDL232W 111 nt2.83□□□□□ -1.96
SPT5P27692 RPS29AYLR388W 171 nt2.83□□□□□ -1.96
SPT5P27692 CMC4YMR194C-B 222 nt2.83□□□□□ -1.96
SPT5P27692 SEC16YPL085W 6588 nt2.83□□□□□ -1.96
SPT5P27692 PDR3YBL005W 2931 nt2.83□□□□□ -1.96
SPT5P27692 SAP185YJL098W 3177 nt2.83□□□□□ -1.96
SPT5P27692 NUP170YBL079W 4509 nt2.82□□□□□ -1.96
SPT5P27692 YNL211CYNL211C 261 nt2.82□□□□□ -1.96
SPT5P27692 ESL2YKR096W 3588 nt2.81□□□□□ -1.96
SPT5P27692 RAV1YJR033C 4074 nt2.81□□□□□ -1.96
SPT5P27692 AGC1YPR021C 2709 nt2.81□□□□□ -1.96
SPT5P27692 NEW1YPL226W 3591 nt2.81□□□□□ -1.96
SPT5P27692 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.81□□□□□ -1.96
SPT5P27692 MSB2YGR014W 3921 nt2.81□□□□□ -1.96
SPT5P27692 YOR019WYOR019W 2193 nt2.8□□□□□ -1.96
SPT5P27692 TOP2YNL088W 4287 nt2.8□□□□□ -1.96
SPT5P27692 TRL1YJL087C 2484 nt2.8□□□□□ -1.96
SPT5P27692 PRP5YBR237W 2550 nt2.79□□□□□ -1.96
SPT5P27692 TTI1YKL033W 3117 nt2.79□□□□□ -1.96
SPT5P27692 SBH1YER087C-B 249 nt2.79□□□□□ -1.96
SPT5P27692 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.79□□□□□ -1.96
SPT5P27692 PKH2YOL100W 3246 nt2.79□□□□□ -1.96
SPT5P27692 MLH1YMR167W 2310 nt2.78□□□□□ -1.96
SPT5P27692 YLR282CYLR282C 342 nt2.78□□□□□ -1.96
SPT5P27692 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.78□□□□□ -1.96
SPT5P27692 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.78□□□□□ -1.96
SPT5P27692 AXL1YPR122W 3627 nt2.78□□□□□ -1.96
SPT5P27692 SYH1YPL105C 2550 nt2.78□□□□□ -1.96
SPT5P27692 BUD2YKL092C 3315 nt2.78□□□□□ -1.97
SPT5P27692 HSL1YKL101W 4557 nt2.78□□□□□ -1.97
SPT5P27692 NAB6YML117W 3405 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT5P27692 COG4YPR105C 2586 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT5P27692 TUS1YLR425W 3924 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT5P27692 YEF3YLR249W 3135 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT5P27692 PDR11YIL013C 4236 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT5P27692 STH1YIL126W 4080 nt2.77□□□□□ -1.97
SPT5P27692 CTR9YOL145C 3234 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT5P27692 CDC60YPL160W 3273 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT5P27692 MDS3YGL197W 4464 nt2.76□□□□□ -1.97
SPT5P27692 UBP15YMR304W 3693 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT5P27692 RPL37BYDR500C 267 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT5P27692 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.75□□□□□ -1.97
SPT5P27692 YLL054CYLL054C 2532 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT5P27692 YDL118WYDL118W 381 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT5P27692 UBP1YDL122W 2430 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT5P27692 APL1YJR005W 2103 nt2.74□□□□□ -1.97
SPT5P27692 SGM1YJR134C 2124 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT5P27692 SLI15YBR156C 2097 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT5P27692 BNI1YNL271C 5862 nt2.73□□□□□ -1.97
SPT5P27692 RTT107YHR154W 3213 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT5P27692 YPP1YGR198W 2454 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT5P27692 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT5P27692 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT5P27692 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT5P27692 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT5P27692 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT5P27692 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.72□□□□□ -1.97
SPT5P27692 KRE33YNL132W 3171 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT5P27692 CHS6YJL099W 2241 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT5P27692 YNL144CYNL144C 2223 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT5P27692 SOM1YEL059C-A 225 nt2.71□□□□□ -1.98
SPT5P27692 PET309YLR067C 2898 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT5P27692 PDR1YGL013C 3207 nt2.7□□□□□ -1.98
SPT5P27692 HIR3YJR140C 4947 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT5P27692 SCP160YJL080C 3669 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT5P27692 IRE1YHR079C 3348 nt2.69□□□□□ -1.98
SPT5P27692 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.68□□□□□ -1.98
SPT5P27692 LHS1YKL073W 2646 nt2.67□□□□□ -1.98
SPT5P27692 SPF1YEL031W 3648 nt2.67□□□□□ -1.98
SPT5P27692 YGL182CYGL182C 324 nt2.66□□□□□ -1.98
SPT5P27692 IRC8YJL051W 2469 nt2.65□□□□□ -1.98
SPT5P27692 REV3YPL167C 4515 nt2.65□□□□□ -1.98
SPT5P27692 YDL206WYDL206W 2289 nt2.65□□□□□ -1.99
SPT5P27692 TIM9YEL020W-A 264 nt2.64□□□□□ -1.99
SPT5P27692 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.64□□□□□ -1.99
SPT5P27692 ADR1YDR216W 3972 nt2.64□□□□□ -1.99
SPT5P27692 STE11YLR362W 2154 nt2.64□□□□□ -1.99
SPT5P27692 RTT101YJL047C 2529 nt2.64□□□□□ -1.99
SPT5P27692 FRK1YPL141C 2598 nt2.63□□□□□ -1.99
SPT5P27692 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.63□□□□□ -1.99
SPT5P27692 SCD5YOR329C 2619 nt2.63□□□□□ -1.99
SPT5P27692 KOG1YHR186C 4674 nt2.62□□□□□ -1.99
SPT5P27692 STB6YKL072W 2301 nt2.62□□□□□ -1.99
SPT5P27692 VPS13YLL040C 9435 nt2.61□□□□□ -1.99
SPT5P27692 STF2YGR008C 255 nt2.61□□□□□ -1.99
SPT5P27692 ARP8YOR141C 2646 nt2.61□□□□□ -1.99
SPT5P27692 IST2YBR086C 2841 nt2.6□□□□□ -1.99
SPT5P27692 UFD2YDL190C 2886 nt2.59□□□□□ -1.99
SPT5P27692 SSD1YDR293C 3753 nt2.59□□□□□ -1.99
SPT5P27692 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.59□□□□□ -1.99
SPT5P27692 YLL020CYLL020C 306 nt2.59□□□□□ -1.99
SPT5P27692 BFR2YDR299W 1605 nt2.59□□□□□ -1.99
SPT5P27692 POL5YEL055C 3069 nt2.59□□□□□ -2
SPT5P27692 SVL3YPL032C 2478 nt2.58□□□□□ -2
SPT5P27692 SFB2YNL049C 2631 nt2.58□□□□□ -2
SPT5P27692 QCR9YGR183C 201 nt2.57□□□□□ -2
SPT5P27692 SPO24YPR036W-A 204 nt2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 196.8 ms