Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM106CQ9BVX2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM106CQ9BVX2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM106CQ9BVX2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms