Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SIRT1Q96EB6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SIRT1Q96EB6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms