Protein–RNA interactions for Protein: Q12408

NPC2, Phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPC2Q12408 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.28□□□□□ -2.04
NPC2Q12408 YOR055WYOR055W 435 nt2.28□□□□□ -2.04
NPC2Q12408 SIR3YLR442C 2937 nt2.28□□□□□ -2.04
NPC2Q12408 RAD34YDR314C 2079 nt2.28□□□□□ -2.04
NPC2Q12408 YNL018CYNL018C 1839 nt2.28□□□□□ -2.04
NPC2Q12408 PDR1YGL013C 3207 nt2.28□□□□□ -2.04
NPC2Q12408 ZIP2YGL249W 2115 nt2.27□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 snR70snR70 164 nt2.27□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt2.27□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 SRO77YBL106C 3033 nt2.27□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 NEW1YPL226W 3591 nt2.26□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 NAM7YMR080C 2916 nt2.26□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 ESC1YMR219W 4977 nt2.26□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 GEA1YJR031C 4227 nt2.26□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 PAU3YCR104W 375 nt2.26□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 MRD1YPR112C 2664 nt2.26□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 NOP14YDL148C 2433 nt2.26□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 CAT2YML042W 2013 nt2.25□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 NOC3YLR002C 1992 nt2.25□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 RPL31AYDL075W 342 nt2.25□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.25□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 FIG4YNL325C 2640 nt2.25□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 ARP8YOR141C 2646 nt2.25□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 BUB1YGR188C 3066 nt2.25□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 SMC6YLR383W 3345 nt2.25□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 YFR016CYFR016C 3702 nt2.25□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 ZIP1YDR285W 2628 nt2.24□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 ATG11YPR049C 3537 nt2.24□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 HSH155YMR288W 2916 nt2.24□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.24□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 HAL9YOL089C 3093 nt2.24□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 SAS3YBL052C 2496 nt2.24□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 AIM44YPL158C 2277 nt2.23□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.23□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 LCL1YPL056C 306 nt2.23□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt2.23□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 DNA2YHR164C 4569 nt2.23□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 MAD1YGL086W 2250 nt2.22□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 DCP2YNL118C 2913 nt2.22□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 YBL109WYBL109W 336 nt2.22□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 ACM1YPL267W 630 nt2.22□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 FLO11YIR019C 4104 nt2.22□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 AHC1YOR023C 1701 nt2.22□□□□□ -2.05
NPC2Q12408 ENV11YGR071C 2583 nt2.21□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 PIG1YLR273C 1947 nt2.21□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 SRB8YCR081W 4284 nt2.21□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 BRP1YGL007W 378 nt2.21□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 VPS8YAL002W 3825 nt2.21□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 MET18YIL128W 3099 nt2.21□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 STE11YLR362W 2154 nt2.2□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 ESL2YKR096W 3588 nt2.2□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 PIP2YOR363C 2991 nt2.2□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 PDR11YIL013C 4236 nt2.2□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 PDR3YBL005W 2931 nt2.2□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 UBR1YGR184C 5853 nt2.2□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 APL5YPL195W 2799 nt2.2□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 APL2YKL135C 2181 nt2.19□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 YPR203WYPR203W 309 nt2.19□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 PHO91YNR013C 2685 nt2.19□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 YDR209CYDR209C 414 nt2.18□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 KTI11YBL071W-A 249 nt2.18□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 YOR102WYOR102W 351 nt2.18□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 YCL001W-BYCL001W-B 255 nt2.18□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 TRS130YMR218C 3309 nt2.18□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 MAK10YEL053C 2202 nt2.18□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 MSB1YOR188W 3414 nt2.17□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 NUP100YKL068W 2880 nt2.17□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 DGR2YKL121W 2559 nt2.16□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 PTP2YOR208W 2253 nt2.16□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.16□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 YJL022WYJL022W 309 nt2.16□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 YPL044CYPL044C 549 nt2.16□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 YPP1YGR198W 2454 nt2.16□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 SLD3YGL113W 2007 nt2.15□□□□□ -2.06
NPC2Q12408 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.15□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 RPS17AYML024W 411 nt2.15□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.15□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 JSN1YJR091C 3276 nt2.15□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 MLH3YPL164C 2148 nt2.15□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 PBY1YBR094W 2262 nt2.14□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 RPS29AYLR388W 171 nt2.14□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 SPF1YEL031W 3648 nt2.14□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 FAR11YNL127W 2862 nt2.14□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.13□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 MSH5YDL154W 2706 nt2.13□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 SVL3YPL032C 2478 nt2.13□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 ISW1YBR245C 3390 nt2.13□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 SBE22YHR103W 2559 nt2.12□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 MLH1YMR167W 2310 nt2.12□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 SGS1YMR190C 4344 nt2.12□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 PSD2YGR170W 3417 nt2.12□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 YDR341CYDR341C 1824 nt2.12□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 YDR239CYDR239C 2364 nt2.12□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 SLN1YIL147C 3663 nt2.11□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 EDS1YBR033W 2760 nt2.11□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 TOP2YNL088W 4287 nt2.11□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 GIP3YPL137C 3831 nt2.1□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 SCP160YJL080C 3669 nt2.1□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 YDR521WYDR521W 336 nt2.1□□□□□ -2.07
NPC2Q12408 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.1 ms