Protein–RNA interactions for Protein: Q06625

GDB1, Glycogen debranching enzyme, yeastyeast

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Length 1,536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GDB1Q06625 CUL3YGR003W 2235 nt-0.56□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 snR8snR8 190 nt-0.56□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 GPG1YGL121C 381 nt-0.56□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.56□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 YCL002CYCL002C 792 nt-0.56□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 YJL086CYJL086C 369 nt-0.57□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 snR24snR24 89 nt-0.57□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 DAD1YDR016C 285 nt-0.58□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 YDR344CYDR344C 444 nt-0.58□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.58□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 RUF20RUF20 443 nt-0.58□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 SOV1YMR066W 2697 nt-0.58□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 LSM4YER112W 564 nt-0.59□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 YGL042CYGL042C 306 nt-0.59□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 RPS7BYNL096C 573 nt-0.59□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 CDC33YOL139C 642 nt-0.59□□□□□ -2.5
GDB1Q06625 RPM2YML091C 3609 nt-0.6□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 THG1YGR024C 714 nt-0.6□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 RPS10BYMR230W 318 nt-0.6□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 TIM13YGR181W 318 nt-0.61□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 CMS1YLR003C 876 nt-0.61□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 YPL044CYPL044C 549 nt-0.61□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 YEL073CYEL073C 324 nt-0.62□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 COX5BYIL111W 456 nt-0.62□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 YJR011CYJR011C 786 nt-0.62□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 AFB1YLR040C 675 nt-0.62□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt-0.62□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 TDA2YER071C 381 nt-0.63□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.63□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 RPS26AYGL189C 360 nt-0.64□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.64□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 YNL211CYNL211C 261 nt-0.64□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 ATP20YPR020W 348 nt-0.64□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 MMS21YEL019C 804 nt-0.64□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 LEE1YPL054W 906 nt-0.64□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 YFR057WYFR057W 456 nt-0.65□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 YPL185WYPL185W 396 nt-0.65□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.65□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 ASE1YOR058C 2658 nt-0.66□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 RFX1YLR176C 2436 nt-0.66□□□□□ -2.51
GDB1Q06625 OST4YDL232W 111 nt-0.66□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 MCM10YIL150C 1716 nt-0.67□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 YDR008CYDR008C 351 nt-0.67□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 PRP21YJL203W 843 nt-0.68□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 ECM9YKR004C 1134 nt-0.68□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 YLR101CYLR101C 396 nt-0.68□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 YNL171CYNL171C 369 nt-0.68□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 snR128snR128 126 nt-0.68□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 TFB6YOR352W 1032 nt-0.68□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 NFU1YKL040C 771 nt-0.69□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.69□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 OLI1Q0130 231 nt-0.69□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 POP6YGR030C 477 nt-0.69□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 MAM33YIL070C 801 nt-0.69□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 VPS63YLR261C 327 nt-0.7□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 YCR022CYCR022C 345 nt-0.71□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.71□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 MRPL31YKL138C 396 nt-0.71□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 GSP1YLR293C 660 nt-0.71□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 YPR099CYPR099C 357 nt-0.71□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 YKU70YMR284W 1809 nt-0.71□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 snR79snR79 84 nt-0.72□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.72□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.72□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 PAN3YKL025C 2040 nt-0.72□□□□□ -2.52
GDB1Q06625 GIM5YML094W 492 nt-0.73□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.73□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 snR57snR57 88 nt-0.74□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.74□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 YNL146WYNL146W 303 nt-0.74□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.74□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 BI4Q0120 1917 nt-0.75□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 COG6YNL041C 2520 nt-0.75□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 YJR079WYJR079W 330 nt-0.75□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.75□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 HTB1YDR224C 396 nt-0.76□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-0.78□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.78□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 NIP1YMR309C 2439 nt-0.78□□□□□ -2.53
GDB1Q06625 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.79□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.79□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YLR271WYLR271W 825 nt-0.79□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 COY1YKL179C 2040 nt-0.79□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.8□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 QCR7YDR529C 384 nt-0.8□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 DFG10YIL049W 762 nt-0.8□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.8□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.8□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-0.81□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.81□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-0.81□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 snR44snR44 211 nt-0.81□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 RUB1YDR139C 234 nt-0.82□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YBR064WYBR064W 429 nt-0.82□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 YGL204CYGL204C 306 nt-0.83□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 SDS22YKL193C 1017 nt-0.83□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 PAA1YDR071C 576 nt-0.84□□□□□ -2.54
GDB1Q06625 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.84□□□□□ -2.54
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