Protein–RNA interactions for Protein: Q03787

YDR249C, Uncharacterized protein YDR249C, yeastyeast

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDR249CQ03787 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 RRT1YBL048W 312 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 TSC3YBR058C-A 243 nt0.63□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 YDL196WYDL196W 330 nt0.62□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 MET32YDR253C 576 nt0.62□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 YGL239CYGL239C 315 nt0.62□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 YIL059CYIL059C 366 nt0.62□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.62□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 ENV11YGR071C 2583 nt0.62□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 WAR1YML076C 2835 nt0.61□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 YDR269CYDR269C 324 nt0.61□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 IES4YOR189W 351 nt0.61□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 RCN2YOR220W 798 nt0.61□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 SLI15YBR156C 2097 nt0.61□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 NPC2YDL046W 522 nt0.6□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 YDR029WYDR029W 315 nt0.6□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 PHS1YJL097W 654 nt0.6□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 RKR1YMR247C 4689 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 GEA2YEL022W 4380 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 YKL123WYKL123W 381 nt0.59□□□□□ -2.31
YDR249CQ03787 EFR3YMR212C 2349 nt0.58□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.58□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.58□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 SWF1YDR126W 1011 nt0.58□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 ALG13YGL047W 609 nt0.58□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 URM1YIL008W 300 nt0.58□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 ALY2YJL084C 3141 nt0.58□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 ZIP2YGL249W 2115 nt0.57□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 YPR153WYPR153W 423 nt0.57□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 DBP6YNR038W 1890 nt0.56□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 RPS27AYKL156W 249 nt0.56□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 RPL9AYGL147C 576 nt0.55□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 YGR042WYGR042W 816 nt0.55□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.55□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 GPI15YNL038W 690 nt0.55□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 YDL073WYDL073W 2955 nt0.54□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.54□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 BIG1YHR101C 1008 nt0.54□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 YPL182CYPL182C 384 nt0.54□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 UTP10YJL109C 5310 nt0.54□□□□□ -2.32
YDR249CQ03787 YML002WYML002W 2214 nt0.53□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YCR001WYCR001W 315 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 GPG1YGL121C 381 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YLR269CYLR269C 351 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 RPB10YOR210W 213 nt0.52□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 ISD11YER048W-A 285 nt0.51□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.51□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.51□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 ECM12YHR021W-A 456 nt0.5□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 RPF1YHR088W 888 nt0.5□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YJL135WYJL135W 318 nt0.5□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 PKH2YOL100W 3246 nt0.5□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 TIM13YGR181W 318 nt0.49□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YCK3YER123W 1575 nt0.49□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 QCR9YGR183C 201 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 NFU1YKL040C 771 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YKL202WYKL202W 582 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 RPL38YLR325C 237 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 PBI2YNL015W 228 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 LOA1YPR139C 903 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 BFR2YDR299W 1605 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YLL007CYLL007C 1998 nt0.48□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 EAF6YJR082C 342 nt0.47□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 YOR282WYOR282W 321 nt0.47□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 PRP16YKR086W 3216 nt0.47□□□□□ -2.33
YDR249CQ03787 PAU12YGR294W 363 nt0.46□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 YOR218CYOR218C 420 nt0.46□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 PAN2YGL094C 3348 nt0.46□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 YOL160WYOL160W 342 nt0.45□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 ULP2YIL031W 3105 nt0.44□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 snR72snR72 98 nt0.44□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 YDR344CYDR344C 444 nt0.44□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 EMC4YGL231C 573 nt0.43□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 YHL042WYHL042W 453 nt0.43□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 YML108WYML108W 318 nt0.43□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 YOL014WYOL014W 375 nt0.43□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 CDC33YOL139C 642 nt0.43□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 LTE1YAL024C 4308 nt0.42□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 WIP1YDR374W-A 270 nt0.42□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 YBL071CYBL071C 309 nt0.42□□□□□ -2.34
YDR249CQ03787 snR51snR51 107 nt0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.1 ms