Protein–RNA interactions for Protein: P47177

YJR149W, Putative nitronate monooxygenase, yeastyeast

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJR149WP47177 NHP2YDL208W 471 nt0.72□□□□□ -2.29
YJR149WP47177 URM1YIL008W 300 nt0.72□□□□□ -2.29
YJR149WP47177 PHS1YJL097W 654 nt0.72□□□□□ -2.29
YJR149WP47177 YOR199WYOR199W 330 nt0.72□□□□□ -2.29
YJR149WP47177 WAR1YML076C 2835 nt0.71□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 SLD3YGL113W 2007 nt0.71□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 YDR521WYDR521W 336 nt0.71□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 CMC4YMR194C-B 222 nt0.71□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 SEC1YDR164C 2175 nt0.7□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 IES4YOR189W 351 nt0.7□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 NUP157YER105C 4176 nt0.7□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 ZIP2YGL249W 2115 nt0.7□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 YPL182CYPL182C 384 nt0.69□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 ENV11YGR071C 2583 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 YCR001WYCR001W 315 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 INA22YIR024C 651 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 EAF6YJR082C 342 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 GEA2YEL022W 4380 nt0.68□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 OST1YJL002C 1431 nt0.67□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 ALG13YGL047W 609 nt0.67□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 YLR269CYLR269C 351 nt0.67□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 YDL196WYDL196W 330 nt0.66□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 RPF1YHR088W 888 nt0.66□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 PBI2YNL015W 228 nt0.66□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 RPB10YOR210W 213 nt0.66□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 ALY2YJL084C 3141 nt0.65□□□□□ -2.3
YJR149WP47177 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.65□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.65□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YJR003CYJR003C 1560 nt0.65□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YDL073WYDL073W 2955 nt0.65□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 DBP6YNR038W 1890 nt0.65□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.64□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 EMC4YGL231C 573 nt0.64□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YPR153WYPR153W 423 nt0.64□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.64□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YMR160WYMR160W 2451 nt0.64□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 GPG1YGL121C 381 nt0.63□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 TIM13YGR181W 318 nt0.63□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.63□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 SWF1YDR126W 1011 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 PKH2YOL100W 3246 nt0.62□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YGR042WYGR042W 816 nt0.61□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YKL202WYKL202W 582 nt0.61□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YML108WYML108W 318 nt0.61□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.61□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 RKR1YMR247C 4689 nt0.61□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 NFU1YKL040C 771 nt0.6□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 ISD11YER048W-A 285 nt0.59□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.59□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YJL135WYJL135W 318 nt0.59□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.59□□□□□ -2.31
YJR149WP47177 PRP16YKR086W 3216 nt0.59□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 UTP20YBL004W 7482 nt0.58□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.58□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YHR125WYHR125W 306 nt0.57□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YBL071CYBL071C 309 nt0.57□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YNR025CYNR025C 360 nt0.57□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YLL007CYLL007C 1998 nt0.56□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 ECM12YHR021W-A 456 nt0.56□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 STE18YJR086W 333 nt0.56□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 CDC33YOL139C 642 nt0.56□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YOR282WYOR282W 321 nt0.56□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YHR130CYHR130C 336 nt0.55□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YLR287CYLR287C 1068 nt0.55□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YOL160WYOL160W 342 nt0.55□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 LOA1YPR139C 903 nt0.55□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 PAN2YGL094C 3348 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 snR72snR72 98 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 ZEO1YOL109W 342 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 snR51snR51 107 nt0.54□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 CUL3YGR003W 2235 nt0.53□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YDL011CYDL011C 324 nt0.53□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.53□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 AIM29YKR074W 468 nt0.53□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 RPL38YLR325C 237 nt0.53□□□□□ -2.32
YJR149WP47177 WIP1YDR374W-A 270 nt0.52□□□□□ -2.33
YJR149WP47177 YPL261CYPL261C 309 nt0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.6 ms