Protein–RNA interactions for Protein: P46965

SPC1, Signal peptidase complex subunit SPC1, yeastyeast

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC1P46965 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.44□□□□□ -2.48
SPC1P46965 YDL187CYDL187C 330 nt-0.45□□□□□ -2.48
SPC1P46965 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt-0.45□□□□□ -2.48
SPC1P46965 ENV11YGR071C 2583 nt-0.45□□□□□ -2.48
SPC1P46965 PAN3YKL025C 2040 nt-0.45□□□□□ -2.48
SPC1P46965 EFR3YMR212C 2349 nt-0.46□□□□□ -2.48
SPC1P46965 NUP120YKL057C 3114 nt-0.46□□□□□ -2.48
SPC1P46965 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.46□□□□□ -2.48
SPC1P46965 CSM4YPL200W 471 nt-0.46□□□□□ -2.48
SPC1P46965 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.47□□□□□ -2.48
SPC1P46965 COX7YMR256C 183 nt-0.47□□□□□ -2.48
SPC1P46965 LEE1YPL054W 906 nt-0.47□□□□□ -2.48
SPC1P46965 snR8snR8 190 nt-0.48□□□□□ -2.49
SPC1P46965 MRPL31YKL138C 396 nt-0.48□□□□□ -2.49
SPC1P46965 CMS1YLR003C 876 nt-0.48□□□□□ -2.49
SPC1P46965 AFB1YLR040C 675 nt-0.48□□□□□ -2.49
SPC1P46965 IRC13YOR235W 315 nt-0.48□□□□□ -2.49
SPC1P46965 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.49□□□□□ -2.49
SPC1P46965 SBH2YER019C-A 267 nt-0.49□□□□□ -2.49
SPC1P46965 DFG10YIL049W 762 nt-0.49□□□□□ -2.49
SPC1P46965 YPL197CYPL197C 414 nt-0.49□□□□□ -2.49
SPC1P46965 YPR099CYPR099C 357 nt-0.49□□□□□ -2.49
SPC1P46965 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.49□□□□□ -2.49
SPC1P46965 YDR008CYDR008C 351 nt-0.5□□□□□ -2.49
SPC1P46965 COX3Q0275 810 nt-0.5□□□□□ -2.49
SPC1P46965 COX5BYIL111W 456 nt-0.5□□□□□ -2.49
SPC1P46965 TFB6YOR352W 1032 nt-0.5□□□□□ -2.49
SPC1P46965 ATC1YDR184C 885 nt-0.51□□□□□ -2.49
SPC1P46965 QCR7YDR529C 384 nt-0.51□□□□□ -2.49
SPC1P46965 BI4Q0120 1917 nt-0.51□□□□□ -2.49
SPC1P46965 GIM5YML094W 492 nt-0.51□□□□□ -2.49
SPC1P46965 SEC10YLR166C 2616 nt-0.52□□□□□ -2.49
SPC1P46965 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.52□□□□□ -2.49
SPC1P46965 RPS26AYGL189C 360 nt-0.52□□□□□ -2.49
SPC1P46965 YJR079WYJR079W 330 nt-0.52□□□□□ -2.49
SPC1P46965 NFU1YKL040C 771 nt-0.52□□□□□ -2.49
SPC1P46965 YLR101CYLR101C 396 nt-0.52□□□□□ -2.49
SPC1P46965 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.52□□□□□ -2.49
SPC1P46965 RAD61YDR014W 1944 nt-0.53□□□□□ -2.49
SPC1P46965 OST4YDL232W 111 nt-0.53□□□□□ -2.49
SPC1P46965 YGL204CYGL204C 306 nt-0.53□□□□□ -2.49
SPC1P46965 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.53□□□□□ -2.49
SPC1P46965 MAM33YIL070C 801 nt-0.53□□□□□ -2.49
SPC1P46965 GSP1YLR293C 660 nt-0.53□□□□□ -2.49
SPC1P46965 snR128snR128 126 nt-0.53□□□□□ -2.49
SPC1P46965 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt-0.53□□□□□ -2.49
SPC1P46965 YER076W-AYER076W-A 348 nt-0.54□□□□□ -2.5
SPC1P46965 ZIP2YGL249W 2115 nt-0.54□□□□□ -2.5
SPC1P46965 PRP21YJL203W 843 nt-0.54□□□□□ -2.5
SPC1P46965 YOR366WYOR366W 354 nt-0.54□□□□□ -2.5
SPC1P46965 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt-0.54□□□□□ -2.5
SPC1P46965 RMD6YEL072W 696 nt-0.55□□□□□ -2.5
SPC1P46965 TDA2YER071C 381 nt-0.55□□□□□ -2.5
SPC1P46965 YJR011CYJR011C 786 nt-0.55□□□□□ -2.5
SPC1P46965 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.55□□□□□ -2.5
SPC1P46965 RFX1YLR176C 2436 nt-0.56□□□□□ -2.5
SPC1P46965 NIP100YPL174C 2607 nt-0.56□□□□□ -2.5
SPC1P46965 YEL073CYEL073C 324 nt-0.56□□□□□ -2.5
SPC1P46965 ECM9YKR004C 1134 nt-0.56□□□□□ -2.5
SPC1P46965 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt-0.56□□□□□ -2.5
SPC1P46965 PSF2YJL072C 642 nt-0.57□□□□□ -2.5
SPC1P46965 YNL146WYNL146W 303 nt-0.57□□□□□ -2.5
SPC1P46965 YNL211CYNL211C 261 nt-0.57□□□□□ -2.5
SPC1P46965 SOV1YMR066W 2697 nt-0.58□□□□□ -2.5
SPC1P46965 MCM10YIL150C 1716 nt-0.58□□□□□ -2.5
SPC1P46965 IRC2YDR112W 309 nt-0.59□□□□□ -2.5
SPC1P46965 GPX1YKL026C 504 nt-0.59□□□□□ -2.5
SPC1P46965 YKL111CYKL111C 336 nt-0.59□□□□□ -2.5
SPC1P46965 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt-0.59□□□□□ -2.5
SPC1P46965 snR59snR59 78 nt-0.6□□□□□ -2.51
SPC1P46965 OLI1Q0130 231 nt-0.6□□□□□ -2.51
SPC1P46965 SDS22YKL193C 1017 nt-0.6□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YKU70YMR284W 1809 nt-0.6□□□□□ -2.51
SPC1P46965 NNF2YGR089W 2811 nt-0.61□□□□□ -2.51
SPC1P46965 RUB1YDR139C 234 nt-0.61□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt-0.61□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt-0.61□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt-0.61□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YOL106WYOL106W 354 nt-0.61□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YPL185WYPL185W 396 nt-0.61□□□□□ -2.51
SPC1P46965 snR44snR44 211 nt-0.61□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YPL225WYPL225W 441 nt-0.62□□□□□ -2.51
SPC1P46965 GLG1YKR058W 1851 nt-0.63□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YER138W-AYER138W-A 105 nt-0.63□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt-0.63□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YLR198CYLR198C 360 nt-0.63□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt-0.63□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YOR364WYOR364W 369 nt-0.63□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YBR064WYBR064W 429 nt-0.63□□□□□ -2.51
SPC1P46965 PAA1YDR071C 576 nt-0.64□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt-0.64□□□□□ -2.51
SPC1P46965 LIN1YHR156C 1023 nt-0.65□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YJL135WYJL135W 318 nt-0.65□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt-0.65□□□□□ -2.51
SPC1P46965 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt-0.66□□□□□ -2.52
SPC1P46965 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt-0.66□□□□□ -2.52
SPC1P46965 YLR271WYLR271W 825 nt-0.66□□□□□ -2.52
SPC1P46965 RRI2YOL117W 1938 nt-0.66□□□□□ -2.52
SPC1P46965 COY1YKL179C 2040 nt-0.67□□□□□ -2.52
SPC1P46965 HTB1YDR224C 396 nt-0.67□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 82.2 ms