Protein–RNA interactions for Protein: P19955

YMR31, 37S ribosomal protein YMR-31, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR31P19955 YJR003CYJR003C 1560 nt0.59□□□□□ -2.31
YMR31P19955 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.59□□□□□ -2.31
YMR31P19955 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.59□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YER135CYER135C 393 nt0.59□□□□□ -2.31
YMR31P19955 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.59□□□□□ -2.31
YMR31P19955 COG4YPR105C 2586 nt0.59□□□□□ -2.32
YMR31P19955 ZIP2YGL249W 2115 nt0.58□□□□□ -2.32
YMR31P19955 EFR3YMR212C 2349 nt0.58□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YPL182CYPL182C 384 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR31P19955 TSC3YBR058C-A 243 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR31P19955 GPG1YGL121C 381 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 RPS27AYKL156W 249 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 RKR1YMR247C 4689 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR31P19955 SNU56YDR240C 1479 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YFL012WYFL012W 447 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR31P19955 RPL9AYGL147C 576 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YGR042WYGR042W 816 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR31P19955 URM1YIL008W 300 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR31P19955 UBX4YMR067C 1251 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YHL042WYHL042W 453 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR31P19955 ECM12YHR021W-A 456 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YOR282WYOR282W 321 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR31P19955 LOA1YPR139C 903 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR31P19955 snR78snR78 87 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YDR029WYDR029W 315 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR31P19955 RPL38YLR325C 237 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR31P19955 YLL007CYLL007C 1998 nt0.52□□□□□ -2.33
YMR31P19955 BIG1YHR101C 1008 nt0.52□□□□□ -2.33
YMR31P19955 YKL202WYKL202W 582 nt0.52□□□□□ -2.33
YMR31P19955 YNL319WYNL319W 441 nt0.52□□□□□ -2.33
YMR31P19955 YJL135WYJL135W 318 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR31P19955 PAC1YOR269W 1485 nt0.51□□□□□ -2.33
YMR31P19955 LTE1YAL024C 4308 nt0.5□□□□□ -2.33
YMR31P19955 YML002WYML002W 2214 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR31P19955 UTP10YJL109C 5310 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR31P19955 YPL261CYPL261C 309 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR31P19955 BFR2YDR299W 1605 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR31P19955 PKH2YOL100W 3246 nt0.49□□□□□ -2.33
YMR31P19955 PMP1YCR024C-A 123 nt0.48□□□□□ -2.33
YMR31P19955 GEA2YEL022W 4380 nt0.48□□□□□ -2.33
YMR31P19955 YMR160WYMR160W 2451 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR31P19955 YCR001WYCR001W 315 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR31P19955 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR31P19955 TIM13YGR181W 318 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR31P19955 YOL160WYOL160W 342 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR31P19955 RPB10YOR210W 213 nt0.47□□□□□ -2.33
YMR31P19955 YKL123WYKL123W 381 nt0.46□□□□□ -2.34
YMR31P19955 NOP9YJL010C 2001 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR31P19955 RPL26AYLR344W 384 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR31P19955 OST1YJL002C 1431 nt0.45□□□□□ -2.34
YMR31P19955 YIR044CYIR044C 186 nt0.44□□□□□ -2.34
YMR31P19955 YOR029WYOR029W 336 nt0.44□□□□□ -2.34
YMR31P19955 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.44□□□□□ -2.34
YMR31P19955 RAD34YDR314C 2079 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR31P19955 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR31P19955 GPI15YNL038W 690 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR31P19955 CHS6YJL099W 2241 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR31P19955 NPR2YEL062W 1848 nt0.43□□□□□ -2.34
YMR31P19955 INA22YIR024C 651 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR31P19955 NFU1YKL040C 771 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR31P19955 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR31P19955 UTP20YBL004W 7482 nt0.42□□□□□ -2.34
YMR31P19955 STF2YGR008C 255 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR31P19955 YLR269CYLR269C 351 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR31P19955 YOR218CYOR218C 420 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR31P19955 CUL3YGR003W 2235 nt0.41□□□□□ -2.34
YMR31P19955 PBI2YNL015W 228 nt0.4□□□□□ -2.35
YMR31P19955 EAF6YJR082C 342 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR31P19955 RPS30BYOR182C 192 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR31P19955 YPL044CYPL044C 549 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR31P19955 YCK3YER123W 1575 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR31P19955 YSP1YHR155W 3687 nt0.39□□□□□ -2.35
YMR31P19955 YDL011CYDL011C 324 nt0.38□□□□□ -2.35
YMR31P19955 snR72snR72 98 nt0.38□□□□□ -2.35
YMR31P19955 YDR344CYDR344C 444 nt0.38□□□□□ -2.35
YMR31P19955 UBC7YMR022W 498 nt0.38□□□□□ -2.35
YMR31P19955 CDC33YOL139C 642 nt0.38□□□□□ -2.35
YMR31P19955 YPL185WYPL185W 396 nt0.38□□□□□ -2.35
YMR31P19955 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR31P19955 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR31P19955 snR51snR51 107 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR31P19955 ULP2YIL031W 3105 nt0.37□□□□□ -2.35
YMR31P19955 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.36□□□□□ -2.35
YMR31P19955 RPF1YHR088W 888 nt0.36□□□□□ -2.35
YMR31P19955 YHR125WYHR125W 306 nt0.36□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.6 ms