Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NEFLP07196 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NEFLP07196 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEFLP07196 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEFLP07196 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
NEFLP07196 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms