Protein–RNA interactions for Protein: O13539

THP2, THO complex subunit THP2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2O13539 PAN2YGL094C 3348 nt0.62□□□□□ -2.31
THP2O13539 DBP6YNR038W 1890 nt0.61□□□□□ -2.31
THP2O13539 YDL016CYDL016C 303 nt0.61□□□□□ -2.31
THP2O13539 MET32YDR253C 576 nt0.61□□□□□ -2.31
THP2O13539 ISD11YER048W-A 285 nt0.61□□□□□ -2.31
THP2O13539 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.61□□□□□ -2.31
THP2O13539 YGR025WYGR025W 303 nt0.6□□□□□ -2.31
THP2O13539 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.6□□□□□ -2.31
THP2O13539 PHS1YJL097W 654 nt0.6□□□□□ -2.31
THP2O13539 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.6□□□□□ -2.31
THP2O13539 YJR003CYJR003C 1560 nt0.59□□□□□ -2.31
THP2O13539 YAR009CYAR009C 3591 nt0.59□□□□□ -2.32
THP2O13539 ZIP2YGL249W 2115 nt0.59□□□□□ -2.32
THP2O13539 EFR3YMR212C 2349 nt0.59□□□□□ -2.32
THP2O13539 COG4YPR105C 2586 nt0.58□□□□□ -2.32
THP2O13539 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.58□□□□□ -2.32
THP2O13539 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.58□□□□□ -2.32
THP2O13539 YER135CYER135C 393 nt0.58□□□□□ -2.32
THP2O13539 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.58□□□□□ -2.32
THP2O13539 PRE4YFR050C 801 nt0.57□□□□□ -2.32
THP2O13539 RKR1YMR247C 4689 nt0.56□□□□□ -2.32
THP2O13539 GPG1YGL121C 381 nt0.56□□□□□ -2.32
THP2O13539 YGR042WYGR042W 816 nt0.56□□□□□ -2.32
THP2O13539 RPS27AYKL156W 249 nt0.56□□□□□ -2.32
THP2O13539 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.56□□□□□ -2.32
THP2O13539 YPL182CYPL182C 384 nt0.56□□□□□ -2.32
THP2O13539 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
THP2O13539 YHL042WYHL042W 453 nt0.55□□□□□ -2.32
THP2O13539 URM1YIL008W 300 nt0.55□□□□□ -2.32
THP2O13539 YOR282WYOR282W 321 nt0.55□□□□□ -2.32
THP2O13539 TSC3YBR058C-A 243 nt0.55□□□□□ -2.32
THP2O13539 RPL9AYGL147C 576 nt0.54□□□□□ -2.32
THP2O13539 ECM12YHR021W-A 456 nt0.54□□□□□ -2.32
THP2O13539 RPL38YLR325C 237 nt0.54□□□□□ -2.32
THP2O13539 LOA1YPR139C 903 nt0.54□□□□□ -2.32
THP2O13539 SNU56YDR240C 1479 nt0.54□□□□□ -2.32
THP2O13539 YLL007CYLL007C 1998 nt0.54□□□□□ -2.32
THP2O13539 UBP3YER151C 2739 nt0.53□□□□□ -2.32
THP2O13539 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.53□□□□□ -2.32
THP2O13539 UBX4YMR067C 1251 nt0.53□□□□□ -2.32
THP2O13539 YDR029WYDR029W 315 nt0.52□□□□□ -2.33
THP2O13539 YFL012WYFL012W 447 nt0.52□□□□□ -2.33
THP2O13539 YKL202WYKL202W 582 nt0.52□□□□□ -2.33
THP2O13539 YJL135WYJL135W 318 nt0.51□□□□□ -2.33
THP2O13539 PAC1YOR269W 1485 nt0.51□□□□□ -2.33
THP2O13539 YML002WYML002W 2214 nt0.5□□□□□ -2.33
THP2O13539 LTE1YAL024C 4308 nt0.5□□□□□ -2.33
THP2O13539 snR78snR78 87 nt0.5□□□□□ -2.33
THP2O13539 BIG1YHR101C 1008 nt0.5□□□□□ -2.33
THP2O13539 PMP1YCR024C-A 123 nt0.49□□□□□ -2.33
THP2O13539 INA22YIR024C 651 nt0.49□□□□□ -2.33
THP2O13539 YNL319WYNL319W 441 nt0.49□□□□□ -2.33
THP2O13539 YPL261CYPL261C 309 nt0.49□□□□□ -2.33
THP2O13539 BFR2YDR299W 1605 nt0.49□□□□□ -2.33
THP2O13539 PKH2YOL100W 3246 nt0.49□□□□□ -2.33
THP2O13539 GEA2YEL022W 4380 nt0.48□□□□□ -2.33
THP2O13539 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.48□□□□□ -2.33
THP2O13539 TIM13YGR181W 318 nt0.47□□□□□ -2.33
THP2O13539 YOL160WYOL160W 342 nt0.47□□□□□ -2.33
THP2O13539 RPB10YOR210W 213 nt0.47□□□□□ -2.33
THP2O13539 OST1YJL002C 1431 nt0.47□□□□□ -2.33
THP2O13539 YCR001WYCR001W 315 nt0.46□□□□□ -2.34
THP2O13539 RPL26AYLR344W 384 nt0.45□□□□□ -2.34
THP2O13539 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.45□□□□□ -2.34
THP2O13539 NOP9YJL010C 2001 nt0.45□□□□□ -2.34
THP2O13539 YIR044CYIR044C 186 nt0.44□□□□□ -2.34
THP2O13539 CHS6YJL099W 2241 nt0.44□□□□□ -2.34
THP2O13539 NPR2YEL062W 1848 nt0.43□□□□□ -2.34
THP2O13539 YKL123WYKL123W 381 nt0.43□□□□□ -2.34
THP2O13539 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.43□□□□□ -2.34
THP2O13539 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt0.43□□□□□ -2.34
THP2O13539 YMR160WYMR160W 2451 nt0.43□□□□□ -2.34
THP2O13539 RAD34YDR314C 2079 nt0.42□□□□□ -2.34
THP2O13539 GPI15YNL038W 690 nt0.42□□□□□ -2.34
THP2O13539 YOR218CYOR218C 420 nt0.41□□□□□ -2.34
THP2O13539 CUL3YGR003W 2235 nt0.41□□□□□ -2.34
THP2O13539 NFU1YKL040C 771 nt0.4□□□□□ -2.35
THP2O13539 YLR269CYLR269C 351 nt0.4□□□□□ -2.35
THP2O13539 PBI2YNL015W 228 nt0.39□□□□□ -2.35
THP2O13539 YOR029WYOR029W 336 nt0.39□□□□□ -2.35
THP2O13539 YPL044CYPL044C 549 nt0.39□□□□□ -2.35
THP2O13539 YCK3YER123W 1575 nt0.39□□□□□ -2.35
THP2O13539 snR72snR72 98 nt0.38□□□□□ -2.35
THP2O13539 UBC7YMR022W 498 nt0.38□□□□□ -2.35
THP2O13539 CDC33YOL139C 642 nt0.38□□□□□ -2.35
THP2O13539 YSP1YHR155W 3687 nt0.37□□□□□ -2.35
THP2O13539 YDR344CYDR344C 444 nt0.37□□□□□ -2.35
THP2O13539 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.37□□□□□ -2.35
THP2O13539 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.37□□□□□ -2.35
THP2O13539 EAF6YJR082C 342 nt0.37□□□□□ -2.35
THP2O13539 YPL185WYPL185W 396 nt0.37□□□□□ -2.35
THP2O13539 snR51snR51 107 nt0.37□□□□□ -2.35
THP2O13539 YDL011CYDL011C 324 nt0.36□□□□□ -2.35
THP2O13539 YHR125WYHR125W 306 nt0.35□□□□□ -2.35
THP2O13539 YBL071CYBL071C 309 nt0.35□□□□□ -2.35
THP2O13539 WIP1YDR374W-A 270 nt0.34□□□□□ -2.36
THP2O13539 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt0.34□□□□□ -2.36
THP2O13539 RPF1YHR088W 888 nt0.34□□□□□ -2.36
THP2O13539 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.34□□□□□ -2.36
THP2O13539 BSC3YLR465C 309 nt0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.4 ms