Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC62Q6P9F0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC62Q6P9F0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms