Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMAD1Q15797 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMAD1Q15797 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
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