Protein–RNA interactions for Protein: Q08474

VAM10, Vacuolar morphogenesis protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VAM10Q08474 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.47□□□□□ -2.33
VAM10Q08474 ALY2YJL084C 3141 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 HNT1YDL125C 477 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YDR220CYDR220C 294 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YPT6YLR262C 648 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YLR271WYLR271W 825 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YPR096CYPR096C 303 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YPR099CYPR099C 357 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 BI4Q0120 1917 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 STO1YMR125W 2586 nt0.46□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 LTE1YAL024C 4308 nt0.45□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YDL206WYDL206W 2289 nt0.45□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 SPO23YBR250W 1572 nt0.45□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 NBL1YHR199C-A 222 nt0.45□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YKL111CYKL111C 336 nt0.45□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.45□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.45□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 MKT1YNL085W 2493 nt0.45□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 PAN3YKL025C 2040 nt0.45□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 PXA2YKL188C 2562 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 snR5snR5 204 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 snR84snR84 550 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 OCA6YDR067C 675 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YGL109WYGL109W 324 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YGR228WYGR228W 345 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 URM1YIL008W 300 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 BMT5YIL096C 1011 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 SDH2YLL041C 801 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 MRPS8YMR158W 468 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 CSM4YPL200W 471 nt0.44□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 FIG4YNL325C 2640 nt0.43□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YGR115CYGR115C 780 nt0.43□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YJR079WYJR079W 330 nt0.43□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 SDS22YKL193C 1017 nt0.43□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.43□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.43□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 SCW11YGL028C 1629 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YGL015CYGL015C 393 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YGL230CYGL230C 444 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 SLM6YBR266C 453 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 LYS14YDR034C 2373 nt0.42□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 PDE2YOR360C 1581 nt0.41□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 MND1YGL183C 660 nt0.41□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YBR032WYBR032W 303 nt0.41□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 UTP10YJL109C 5310 nt0.41□□□□□ -2.34
VAM10Q08474 YDR114CYDR114C 303 nt0.4□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YGR042WYGR042W 816 nt0.4□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YPR153WYPR153W 423 nt0.4□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YCL002CYCL002C 792 nt0.4□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YSP1YHR155W 3687 nt0.39□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YCR100CYCR100C 951 nt0.39□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 MPC1YGL080W 393 nt0.39□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 SCEIQ0160 708 nt0.39□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 IES4YOR189W 351 nt0.39□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YBR071WYBR071W 636 nt0.39□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 SLY1YDR189W 2001 nt0.38□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 SWI6YLR182W 2412 nt0.38□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 snR9snR9 187 nt0.38□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.38□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YBR063CYBR063C 1215 nt0.38□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 LCD1YDR499W 2244 nt0.37□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 ULP2YIL031W 3105 nt0.37□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 ALG13YGL047W 609 nt0.37□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 RPL38YLR325C 237 nt0.37□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 GMC2YLR445W 567 nt0.37□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YMR254CYMR254C 309 nt0.37□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YML002WYML002W 2214 nt0.37□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 MMS4YBR098W 2076 nt0.36□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YDL187CYDL187C 330 nt0.36□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YAL066WYAL066W 309 nt0.36□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 UPS1YLR193C 528 nt0.36□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 BFR2YDR299W 1605 nt0.35□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 ECM12YHR021W-A 456 nt0.35□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 RRT1YBL048W 312 nt0.35□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YOR218CYOR218C 420 nt0.35□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YOR248WYOR248W 303 nt0.35□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 DBP6YNR038W 1890 nt0.35□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 YLL032CYLL032C 2478 nt0.35□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 WAR1YML076C 2835 nt0.34□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 FMP27YLR454W 7887 nt0.34□□□□□ -2.35
VAM10Q08474 MET32YDR253C 576 nt0.34□□□□□ -2.36
VAM10Q08474 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.34□□□□□ -2.36
VAM10Q08474 PHS1YJL097W 654 nt0.34□□□□□ -2.36
VAM10Q08474 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.34□□□□□ -2.36
VAM10Q08474 RPL32YBL092W 393 nt0.34□□□□□ -2.36
VAM10Q08474 YLL007CYLL007C 1998 nt0.34□□□□□ -2.36
VAM10Q08474 YCK3YER123W 1575 nt0.33□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.9 ms