Protein–RNA interactions for Protein: Q08109

HRD1, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase HRD1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRD1Q08109 OCA6YDR067C 675 nt0.51□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YDR220CYDR220C 294 nt0.51□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YLR271WYLR271W 825 nt0.51□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YPR096CYPR096C 303 nt0.51□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 ZIP1YDR285W 2628 nt0.51□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YDL206WYDL206W 2289 nt0.5□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 PAN3YKL025C 2040 nt0.5□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 STO1YMR125W 2586 nt0.5□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 HNT1YDL125C 477 nt0.5□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.5□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 BMT5YIL096C 1011 nt0.5□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 MRPS8YMR158W 468 nt0.5□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 SLM6YBR266C 453 nt0.5□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YSP1YHR155W 3687 nt0.5□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 LTE1YAL024C 4308 nt0.5□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YGR115CYGR115C 780 nt0.49□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YGR228WYGR228W 345 nt0.49□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.49□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.49□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.49□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 LYS14YDR034C 2373 nt0.49□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 AIM44YPL158C 2277 nt0.48□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YDR114CYDR114C 303 nt0.48□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.48□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YGL015CYGL015C 393 nt0.48□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YGL230CYGL230C 444 nt0.48□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YKL111CYKL111C 336 nt0.48□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 SDS22YKL193C 1017 nt0.48□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 PDE2YOR360C 1581 nt0.48□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 snR5snR5 204 nt0.47□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 snR84snR84 550 nt0.47□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.47□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YJR079WYJR079W 330 nt0.47□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 RPL38YLR325C 237 nt0.47□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YBR032WYBR032W 303 nt0.47□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 FMP27YLR454W 7887 nt0.47□□□□□ -2.33
HRD1Q08109 YLL007CYLL007C 1998 nt0.46□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 SCW11YGL028C 1629 nt0.46□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 UTP20YBL004W 7482 nt0.46□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 MPC1YGL080W 393 nt0.46□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 MND1YGL183C 660 nt0.46□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 SDH2YLL041C 801 nt0.46□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 YOR029WYOR029W 336 nt0.46□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 YPR153WYPR153W 423 nt0.46□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 YCL002CYCL002C 792 nt0.46□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 SLY1YDR189W 2001 nt0.45□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 YMR160WYMR160W 2451 nt0.45□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 YOR248WYOR248W 303 nt0.45□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.44□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 SWI6YLR182W 2412 nt0.44□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 FIG4YNL325C 2640 nt0.43□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 SCEIQ0160 708 nt0.43□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 UPS1YLR193C 528 nt0.43□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 GMC2YLR445W 567 nt0.43□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 YBR071WYBR071W 636 nt0.43□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 OST1YJL002C 1431 nt0.42□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 ECM12YHR021W-A 456 nt0.42□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 URM1YIL008W 300 nt0.42□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 LCD1YDR499W 2244 nt0.42□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 YDL187CYDL187C 330 nt0.41□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 ALG13YGL047W 609 nt0.41□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 YGR042WYGR042W 816 nt0.41□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 RRT1YBL048W 312 nt0.41□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 IES4YOR189W 351 nt0.41□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 MMS4YBR098W 2076 nt0.41□□□□□ -2.34
HRD1Q08109 YLL032CYLL032C 2478 nt0.4□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YCR100CYCR100C 951 nt0.4□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 snR9snR9 187 nt0.4□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.4□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.4□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YIL059CYIL059C 366 nt0.4□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YAL066WYAL066W 309 nt0.4□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 PAN2YGL094C 3348 nt0.4□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YHL042WYHL042W 453 nt0.39□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.39□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.39□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YBR063CYBR063C 1215 nt0.39□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 MET32YDR253C 576 nt0.38□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 ISD11YER048W-A 285 nt0.38□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 INA22YIR024C 651 nt0.38□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.38□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YMR254CYMR254C 309 nt0.38□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 BFR2YDR299W 1605 nt0.38□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 PAC1YOR269W 1485 nt0.37□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 ECM9YKR004C 1134 nt0.37□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 RPL32YBL092W 393 nt0.37□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 DBP6YNR038W 1890 nt0.37□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.36□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.36□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YJR087WYJR087W 351 nt0.36□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 MRPL31YKL138C 396 nt0.36□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 YLR252WYLR252W 306 nt0.36□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 RFX1YLR176C 2436 nt0.36□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 ESP1YGR098C 4893 nt0.35□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 WAR1YML076C 2835 nt0.35□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 STF2YGR008C 255 nt0.35□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 ABF2YMR072W 552 nt0.35□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 PPN1YDR452W 2025 nt0.35□□□□□ -2.35
HRD1Q08109 PMP1YCR024C-A 123 nt0.34□□□□□ -2.36
HRD1Q08109 SPO13YHR014W 876 nt0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 87.5 ms