Protein–RNA interactions for Protein: Q12218

TIR4, Cell wall protein TIR4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIR4Q12218 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.52□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 RPL9BYNL067W 576 nt1.52□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.52□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 NAB6YML117W 3405 nt1.52□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 RTT107YHR154W 3213 nt1.52□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 SLM1YIL105C 2061 nt1.52□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 SEF1YBL066C 3447 nt1.51□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 PAN3YKL025C 2040 nt1.51□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.51□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YDL011CYDL011C 324 nt1.51□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YBR012CYBR012C 420 nt1.51□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YOR121CYOR121C 306 nt1.51□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 ATG9YDL149W 2994 nt1.51□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YNL144CYNL144C 2223 nt1.51□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 NUP120YKL057C 3114 nt1.51□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 FIG2YCR089W 4830 nt1.5□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 TOF2YKR010C 2316 nt1.5□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YDL152WYDL152W 366 nt1.5□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 Q0142Q0142 177 nt1.5□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.5□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YPP1YGR198W 2454 nt1.5□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 PKH3YDR466W 2697 nt1.5□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YJR098CYJR098C 1971 nt1.49□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 RPS27AYKL156W 249 nt1.49□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 PGA1YNL158W 597 nt1.49□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YBL108WYBL108W 306 nt1.49□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 RPH1YER169W 2391 nt1.49□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 TFC8YPL007C 1767 nt1.49□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 SSQ1YLR369W 1974 nt1.48□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 PCF11YDR228C 1881 nt1.48□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YCR043CYCR043C 384 nt1.48□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.48□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 WIP1YDR374W-A 270 nt1.48□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 TIM13YGR181W 318 nt1.48□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 RPL42BYHR141C 321 nt1.48□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.48□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 RPL42AYNL162W 321 nt1.48□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 ZRG8YER033C 3231 nt1.48□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 GRR1YJR090C 3456 nt1.47□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.47□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.47□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.47□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 CYB5YNL111C 363 nt1.47□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.47□□□□□ -2.17
TIR4Q12218 AIM9YER080W 1884 nt1.46□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 FAB1YFR019W 6837 nt1.46□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 CFT2YLR115W 2580 nt1.46□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YAP6YDR259C 1152 nt1.46□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YGR035CYGR035C 351 nt1.46□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.46□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.46□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 RPL26AYLR344W 384 nt1.46□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 PEP1YBL017C 4740 nt1.46□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 SBE22YHR103W 2559 nt1.46□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 MMS22YLR320W 4365 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 PHS1YJL097W 654 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 RPA34YJL148W 702 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YKL083WYKL083W 615 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 TMA10YLR327C 261 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 CGI121YML036W 546 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 ISF1YMR081C 1017 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 HCH1YNL281W 462 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 RPL32YBL092W 393 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YPR197CYPR197C 564 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YJR003CYJR003C 1560 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 CFT1YDR301W 4074 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 BUD2YKL092C 3315 nt1.45□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 PEX8YGR077C 1770 nt1.44□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 PLC1YPL268W 2610 nt1.44□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 IRA1YBR140C 9279 nt1.44□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YPL229WYPL229W 621 nt1.44□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 TUS1YLR425W 3924 nt1.44□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 IRE1YHR079C 3348 nt1.43□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 LHS1YKL073W 2646 nt1.43□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YJR039WYJR039W 3366 nt1.43□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 ARP7YPR034W 1434 nt1.43□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 GUP1YGL084C 1683 nt1.43□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YML003WYML003W 873 nt1.43□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YNL114CYNL114C 372 nt1.43□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YBP1YBR216C 2025 nt1.43□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YLR422WYLR422W 5799 nt1.43□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YDR008CYDR008C 351 nt1.42□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 RKM1YPL208W 1752 nt1.42□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 SWI5YDR146C 2130 nt1.41□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YAR053WYAR053W 297 nt1.41□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 YNL058CYNL058C 951 nt1.41□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 FMP23YBR047W 528 nt1.41□□□□□ -2.18
TIR4Q12218 SEC63YOR254C 1992 nt1.4□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.4□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 IRC23YOR044W 474 nt1.4□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 HHT1YBR010W 411 nt1.4□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YCL023CYCL023C 348 nt1.4□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 HSL1YKL101W 4557 nt1.4□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 MON2YNL297C 4911 nt1.4□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YIL059CYIL059C 366 nt1.39□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 YBL073WYBL073W 312 nt1.39□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 BIL1YOR304C-A 231 nt1.39□□□□□ -2.19
TIR4Q12218 SWI6YLR182W 2412 nt1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 68.2 ms