Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC63Q05C16 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms