Protein–RNA interactions for Protein: Q02203

YKR005C, Uncharacterized protein YKR005C, yeastyeast

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR005CQ02203 RSM27YGR215W 333 nt0.69□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 YHR054CYHR054C 1065 nt0.69□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 PAM16YJL104W 450 nt0.69□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 SWS2YNL081C 432 nt0.69□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 YPR170CYPR170C 336 nt0.69□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 HDA3YPR179C 1968 nt0.68□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 NUT1YGL151W 3399 nt0.68□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 snR79snR79 84 nt0.68□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 NHP2YDL208W 471 nt0.68□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 TMA22YJR014W 597 nt0.68□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.68□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 SMB1YER029C 591 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 NBP1YLR457C 960 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 YPR147CYPR147C 915 nt0.67□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 PRM8YGL053W 714 nt0.66□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 TAD1YGL243W 1203 nt0.66□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 NBL1YHR199C-A 222 nt0.66□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 COX7YMR256C 183 nt0.66□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 KAR1YNL188W 1302 nt0.65□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 AIM9YER080W 1884 nt0.65□□□□□ -2.3
YKR005CQ02203 LRP1YHR081W 555 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 SPC2YML055W 537 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.65□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 MRPL32YCR003W 552 nt0.64□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 SRP14YDL092W 441 nt0.64□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YDL152WYDL152W 366 nt0.64□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.64□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YDR521WYDR521W 336 nt0.64□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.64□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 CYC7YEL039C 342 nt0.64□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YPL197CYPL197C 414 nt0.64□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YOP1YPR028W 543 nt0.64□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 TOF2YKR010C 2316 nt0.64□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 NOC3YLR002C 1992 nt0.63□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 GPM2YDL021W 936 nt0.63□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 TIM10YHR005C-A 282 nt0.63□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YBR012CYBR012C 420 nt0.63□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 MPT5YGL178W 2580 nt0.63□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 ZIP1YDR285W 2628 nt0.63□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 BI4Q0120 1917 nt0.62□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YGR045CYGR045C 363 nt0.62□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 MRPS8YMR158W 468 nt0.62□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 CMC4YMR194C-B 222 nt0.62□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 POP7YBR167C 423 nt0.62□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 CDC24YAL041W 2565 nt0.62□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 SWI5YDR146C 2130 nt0.62□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 UTP13YLR222C 2454 nt0.61□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YGR115CYGR115C 780 nt0.61□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YAP3YHL009C 993 nt0.61□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 RPL16AYIL133C 600 nt0.61□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YKL111CYKL111C 336 nt0.61□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YPT6YLR262C 648 nt0.61□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.61□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.61□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.61□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 NUP157YER105C 4176 nt0.6□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 PIG1YLR273C 1947 nt0.6□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 snR5snR5 204 nt0.6□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YDR220CYDR220C 294 nt0.6□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YGL230CYGL230C 444 nt0.6□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.6□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.6□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 NUT2YPR168W 474 nt0.6□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 SET3YKR029C 2256 nt0.6□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 QCR7YDR529C 384 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YGL109WYGL109W 324 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 YPR096CYPR096C 303 nt0.59□□□□□ -2.31
YKR005CQ02203 HNT1YDL125C 477 nt0.58□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 RPC10YHR143W-A 213 nt0.58□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 RUF22RUF22 515 nt0.58□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 VAM3YOR106W 852 nt0.58□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 UTP20YBL004W 7482 nt0.58□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 YDL073WYDL073W 2955 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 YDR509WYDR509W 348 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 YGL015CYGL015C 393 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 SDS22YKL193C 1017 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 YOR029WYOR029W 336 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 YDL206WYDL206W 2289 nt0.57□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 RIM20YOR275C 1986 nt0.56□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 MKT1YNL085W 2493 nt0.56□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 AIM44YPL158C 2277 nt0.56□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 PAN3YKL025C 2040 nt0.56□□□□□ -2.32
YKR005CQ02203 MXR1YER042W 555 nt0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 75.5 ms