Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	MIC19	YFR011C	513 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	TCA17	YEL048C	459 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	YJL127W-A	YJL127W-A	117 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	YOL035C	YOL035C	303 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	BFR1	YOR198C	1413 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	YCR022C	YCR022C	345 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	YDR355C	YDR355C	303 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	TIM21	YGR033C	720 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	DDR48	YMR173W	1293 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	CIN2	YPL241C	807 nt		-0.88	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	REF2	YDR195W	1602 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	DAD1	YDR016C	285 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	RPC25	YKL144C	639 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	YOR203W	YOR203W	354 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	ARL3	YPL051W	597 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	YBR206W	YBR206W	324 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	RFX1	YLR176C	2436 nt		-0.9	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	CET1	YPL228W	1650 nt		-0.91	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	CLG1	YGL215W	1359 nt		-0.91	□□□□□ -2.55
DDR2	P89113	RAD10	YML095C	633 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YCR043C	YCR043C	384 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	HNT1	YDL125C	477 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YGR064W	YGR064W	369 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	HAL9	YOL089C	3093 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	PDE2	YOR360C	1581 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	DSE1	YER124C	1722 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	PMP1	YCR024C-A	123 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	ERV15	YBR210W	429 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	ARP9	YMR033W	1404 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	ORC3	YLL004W	1851 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	CTK1	YKL139W	1587 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	NOP12	YOL041C	1380 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YDL025W-A	YDL025W-A	105 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	MUM2	YBR057C	1101 nt		-0.95	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YJL113W	YJL113W	4647 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	TAN1	YGL232W	870 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YGR042W	YGR042W	816 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YGR114C	YGR114C	390 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YJL026C-A	YJL026C-A	222 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YAL064W	YAL064W	285 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YOP1	YPR028W	543 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YBL100W-A	YBL100W-A	1317 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	NIP100	YPL174C	2607 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	RPS7B	YNL096C	573 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
DDR2	P89113	PTP2	YOR208W	2253 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	NPC2	YDL046W	522 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	UPF3	YGR072W	1164 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	snR128	snR128	126 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		-1	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	YJL156W-A	YJL156W-A	222 nt		-1	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	YBR224W	YBR224W	516 nt		-1.01	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	RRG1	YDR065W	1098 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	DXO1	YDR370C	1329 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	TMA20	YER007C-A	546 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	YFR010W-A	YFR010W-A	189 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	TIM10	YHR005C-A	282 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	PFK27	YOL136C	1194 nt		-1.02	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	YJL007C	YJL007C	315 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	YNL150W	YNL150W	408 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	VPS28	YPL065W	729 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		-1.03	□□□□□ -2.57
DDR2	P89113	FYV10	YIL097W	1551 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	MIX23	YBL107C	591 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	IZH4	YOL101C	939 nt		-1.04	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	SPO74	YGL170C	1242 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	YLR252W	YLR252W	306 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	NOC3	YLR002C	1992 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	AI5_ALPHA	Q0070	1893 nt		-1.05	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	MYO1	YHR023W	5787 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	NIP1	YMR309C	2439 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	SCW11	YGL028C	1629 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	ECM11	YDR446W	909 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	TIM13	YGR181W	318 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	COX5B	YIL111W	456 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	snR36	snR36	182 nt		-1.06	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	CGI121	YML036W	546 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	RUF22	RUF22	515 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	snR33	snR33	183 nt		-1.07	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	YDR199W	YDR199W	366 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	YLR458W	YLR458W	381 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	LEE1	YPL054W	906 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	SPO23	YBR250W	1572 nt		-1.08	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	ECM25	YJL201W	1800 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	YGR265W	YGR265W	411 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	DIE2	YGR227W	1578 nt		-1.09	□□□□□ -2.58
DDR2	P89113	YPL080C	YPL080C	327 nt		-1.1	□□□□□ -2.59
DDR2	P89113	YNL143C	YNL143C	393 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
DDR2	P89113	snR35	snR35	204 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
DDR2	P89113	YCL002C	YCL002C	792 nt		-1.11	□□□□□ -2.59
DDR2	P89113	YBL029W	YBL029W	1131 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
DDR2	P89113	YNL144W-A	YNL144W-A	84 nt		-1.12	□□□□□ -2.59
DDR2	P89113	YBL094C	YBL094C	333 nt		-1.12	□□□□□ -2.59

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 92.3 ms