Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNE2O96020 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNE2O96020 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms