Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

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Length 1,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 YGL217CYGL217C 342 nt0.32□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YAR053WYAR053W 297 nt0.32□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 AEP1YMR064W 1557 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 GDS1YOR355W 1569 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 SGO1YOR073W 1773 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 TMA20YER007C-A 546 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 EDC1YGL222C 528 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YLL020CYLL020C 306 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 NBP1YLR457C 960 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YOL150CYOL150C 312 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 IES4YOR189W 351 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YBR224WYBR224W 516 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 ARP9YMR033W 1404 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 BPH1YCR032W 6504 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 NGG1YDR176W 2109 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 URB1YKL014C 5295 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 VMA7YGR020C 357 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YIR020CYIR020C 303 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 MFA2YNL145W 117 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 MUM2YBR057C 1101 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 PEX34YCL056C 435 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 HDA3YPR179C 1968 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 VAB2YEL005C 849 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 POP8YBL018C 402 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YET2YMR040W 483 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 DLT1YMR126C 1029 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YMR324CYMR324C 243 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 RPL9BYNL067W 576 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 AI4Q0065 1671 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 OSH6YKR003W 1347 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 GLG1YKR058W 1851 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YDR248CYDR248C 582 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 SLD5YDR489W 885 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 SEC22YLR268W 645 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 ESP1YGR098C 4893 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-8P0CX22 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 YNR021WYNR021W 1215 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 BRX1YOL077C 876 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 COG7YGL005C 840 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 YGR045CYGR045C 363 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 RPC25YKL144C 639 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 NTC20YBR188C 423 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 SLS1YLR139C 1932 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 NUR1YDL089W 1455 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 YCR043CYCR043C 384 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 MXR1YER042W 555 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 IZH4YOL101C 939 nt0.25□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 RTR1YER139C 681 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 MMS2YGL087C 414 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 GRX8YLR364W 330 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 VPS28YPL065W 729 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 PGA1YNL158W 597 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 snR13snR13 124 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 RRP15YPR143W 753 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 GPX2YBR244W 489 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 YJL114WYJL114W 681 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 YLR031WYLR031W 561 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 CGI121YML036W 546 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 SUT2YPR009W 807 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 SPT21YMR179W 2277 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 TOF2YKR010C 2316 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 ULI1YFR026C 510 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 YDL196WYDL196W 330 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-8P0CX22 RCN1YKL159C 636 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YAL064WYAL064W 285 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YKE2YLR200W 345 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YDL206WYDL206W 2289 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 MAM1YER106W 909 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 NEJ1YLR265C 1029 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 SPC2YML055W 537 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YBR012CYBR012C 420 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 UTP10YJL109C 5310 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 MPT5YGL178W 2580 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 snR63snR63 255 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YDR262WYDR262W 819 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 DUO1YGL061C 744 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YOL024WYOL024W 519 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YPL034WYPL034W 498 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YOR053WYOR053W 342 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 NUT1YGL151W 3399 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 NDD1YOR372C 1665 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YDR509WYDR509W 348 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 BMT5YIL096C 1011 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YCR016WYCR016W 873 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 SWF1YDR126W 1011 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 GMC2YLR445W 567 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 CYC7YEL039C 342 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 MRPL50YNR022C 420 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YPR142CYPR142C 564 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 NUT2YPR168W 474 nt0.16□□□□□ -2.38
YRF1-8P0CX22 YBP2YGL060W 1926 nt0.15□□□□□ -2.39
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