Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC4BQ9NT99 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC4BQ9NT99 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms