Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YML039WYML039W 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YML045WYML045W 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YMR050CYMR050C 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 DNL4YOR005C 2835 nt2.46□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 KEL2YGR238C 2649 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 SCP160YJL080C 3669 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 ECM25YJL201W 1800 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 NOT5YPR072W 1683 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YDL011CYDL011C 324 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 RPL26AYLR344W 384 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 ISF1YMR081C 1017 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 RPL25YOL127W 429 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YOR225WYOR225W 330 nt2.45□□□□□ -2.02 RIP-Chip
PUF2Q12221 BRO1YPL084W 2535 nt2.45□□□□□ -2.02 RIP-Chip
PUF2Q12221 PCF11YDR228C 1881 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 SGS1YMR190C 4344 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 SMC6YLR383W 3345 nt2.45□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.44□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 WIP1YDR374W-A 270 nt2.44□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YER189WYER189W 369 nt2.44□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.44□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YJL181WYJL181W 1836 nt2.44□□□□□ -2.02 RIP-Chip
PUF2Q12221 NUM1YDR150W 8247 nt2.44□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 ASG1YIL130W 2895 nt2.43□□□□□ -2.02 RIP-Chip
PUF2Q12221 CDC24YAL041W 2565 nt2.43□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 snR76snR76 109 nt2.43□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 HYP2YEL034W 474 nt2.43□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.43□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 FPR1YNL135C 345 nt2.43□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 RLI1YDR091C 1827 nt2.42□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 PSK2YOL045W 3306 nt2.42□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 RKM1YPL208W 1752 nt2.42□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.42□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.42□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 LCL2YLR104W 396 nt2.42□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 RPS18BYML026C 441 nt2.42□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 JLP2YMR132C 627 nt2.42□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 NAN1YPL126W 2691 nt2.42□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 NUP120YKL057C 3114 nt2.42□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 DAD4YDR320C-A 219 nt2.41□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.41□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.41□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YLR458WYLR458W 381 nt2.41□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 YNL337WYNL337W 255 nt2.41□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 ACM1YPL267W 630 nt2.41□□□□□ -2.02 RIP-Chip
PUF2Q12221 TOP2YNL088W 4287 nt2.41□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 BNR1YIL159W 4128 nt2.41□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 NFT1YKR103W 3657 nt2.41□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 MRD1YPR112C 2664 nt2.41□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 SUL1YBR294W 2580 nt2.4□□□□□ -2.02
PUF2Q12221 PSD2YGR170W 3417 nt2.4□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 RPL40AYIL148W 387 nt2.4□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YJL015CYJL015C 285 nt2.4□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 RPL36AYMR194W 303 nt2.4□□□□□ -2.03 RIP-Chip
PUF2Q12221 ISW1YBR245C 3390 nt2.4□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 MSS11YMR164C 2277 nt2.4□□□□□ -2.03 RIP-Chip
PUF2Q12221 APL5YPL195W 2799 nt2.4□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 IRC10YOL015W 1761 nt2.39□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 Q0032Q0032 291 nt2.39□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 snR79snR79 84 nt2.39□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 CCW14YLR390W-A 717 nt2.39□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 CRS5YOR031W 210 nt2.39□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YPL182CYPL182C 384 nt2.39□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YBR197CYBR197C 654 nt2.39□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 MGR1YCL044C 1254 nt2.39□□□□□ -2.03 RIP-Chip
PUF2Q12221 SGM1YJR134C 2124 nt2.39□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YIL080WYIL080W 4722 nt2.39□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 PRK1YIL095W 2433 nt2.38□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 BAS1YKR099W 2436 nt2.38□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 MZM1YDR493W 372 nt2.38□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YER121WYER121W 345 nt2.38□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 RAM2YKL019W 951 nt2.38□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 TAR1YLR154W-C 375 nt2.38□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YKU80YMR106C 1890 nt2.38□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YOP1YPR028W 543 nt2.38□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 snR51snR51 107 nt2.38□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 AMS1YGL156W 3252 nt2.38□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 PDR11YIL013C 4236 nt2.38□□□□□ -2.03 RIP-Chip
PUF2Q12221 SDC25YLL016W 3147 nt2.37□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 CYC7YEL039C 342 nt2.37□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 SMY2YBR172C 2223 nt2.37□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 VTC1YER072W 390 nt2.36□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 RPS24AYER074W 408 nt2.36□□□□□ -2.03 RIP-Chip
PUF2Q12221 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.36□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.36□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.36□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.36□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 INO80YGL150C 4470 nt2.36□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 SGO1YOR073W 1773 nt2.36□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 AIM9YER080W 1884 nt2.35□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 RPL35AYDL191W 363 nt2.35□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YGL149WYGL149W 306 nt2.35□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YGR265WYGR265W 411 nt2.35□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 RPS29AYLR388W 171 nt2.35□□□□□ -2.03
PUF2Q12221 YPR146CYPR146C 330 nt2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 46.1 ms