Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAD1O00515 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAD1O00515 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAD1O00515 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAD1O00515 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAD1O00515 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAD1O00515 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAD1O00515 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAD1O00515 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LAD1O00515 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAD1O00515 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAD1O00515 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAD1O00515 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAD1O00515 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAD1O00515 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms