Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NOP58Q9Y2X3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NOP58Q9Y2X3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms