Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC82Q8N4S0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC82Q8N4S0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.1 ms