Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM106CQ9BVX2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM106CQ9BVX2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms