Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CDKN3Q16667 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDKN3Q16667 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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