Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF1CQ15572 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
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