Protein–RNA interactions for Protein: P0CF17

YML002W, UPF0507 protein YML002W, yeastyeast

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YML002WP0CF17 RGA2YDR379W 3030 nt2.59□□□□□ -2
YML002WP0CF17 RLF2YPR018W 1821 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 UTP13YLR222C 2454 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 SDH7YDR511W 402 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 PEP8YJL053W 1140 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 PAU23YLR037C 375 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 CGI121YML036W 546 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 KTI11YBL071W-A 249 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 ATP3YBR039W 936 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 PUF4YGL014W 2667 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 BFR1YOR198C 1413 nt2.58□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 RPL27BYDR471W 411 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 RPS26BYER131W 360 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YGL165CYGL165C 579 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 RPS29AYLR388W 171 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YOR050CYOR050C 348 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 RPS12YOR369C 432 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YPL276WYPL276W 438 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 FAR11YNL127W 2862 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 SMY2YBR172C 2223 nt2.57□□□□□ -2
YML002WP0CF17 COG3YER157W 2406 nt2.56□□□□□ -2
YML002WP0CF17 snR76snR76 109 nt2.56□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YER181CYER181C 324 nt2.56□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.56□□□□□ -2
YML002WP0CF17 RGM1YMR182C 636 nt2.56□□□□□ -2
YML002WP0CF17 RPL36AYMR194W 303 nt2.56□□□□□ -2
YML002WP0CF17 ZEO1YOL109W 342 nt2.56□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.56□□□□□ -2
YML002WP0CF17 AMS1YGL156W 3252 nt2.56□□□□□ -2
YML002WP0CF17 SMC6YLR383W 3345 nt2.55□□□□□ -2
YML002WP0CF17 RPS24BYIL069C 408 nt2.55□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.55□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YKU80YMR106C 1890 nt2.55□□□□□ -2
YML002WP0CF17 ESF2YNR054C 951 nt2.55□□□□□ -2
YML002WP0CF17 PHO91YNR013C 2685 nt2.55□□□□□ -2
YML002WP0CF17 SVL3YPL032C 2478 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 TRA1YHR099W 11235 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 URA10YMR271C 684 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 PEX17YNL214W 600 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 SWM2YNR004W 441 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YOL150CYOL150C 312 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 CRS5YOR031W 210 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 FMP23YBR047W 528 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 TSC3YBR058C-A 243 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 STE11YLR362W 2154 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 TPS2YDR074W 2691 nt2.54□□□□□ -2
YML002WP0CF17 TRZ1YKR079C 2517 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 MES1YGR264C 2256 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 CDC50YCR094W 1176 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 ADK1YDR226W 669 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YGR035CYGR035C 351 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YGR050CYGR050C 357 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YJL202CYJL202C 348 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YKL136WYKL136W 399 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 MRPL31YKL138C 396 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 SIP18YMR175W 240 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 ERP4YOR016C 624 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YPL039WYPL039W 951 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 KRE33YNL132W 3171 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 SGS1YMR190C 4344 nt2.53□□□□□ -2
YML002WP0CF17 SIR3YLR442C 2937 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 MLH1YMR167W 2310 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 INO80YGL150C 4470 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 FYV4YHR059W 393 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 GPI14YJR013W 1212 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 AIM32YML050W 936 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 YOR121CYOR121C 306 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 HRD3YLR207W 2502 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 SIP3YNL257C 3690 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 ORC2YBR060C 1863 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 JIP5YPR169W 1479 nt2.52□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 MSB1YOR188W 3414 nt2.51□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 ROY1YMR258C 1662 nt2.51□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 RAD6YGL058W 519 nt2.51□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 YGR025WYGR025W 303 nt2.51□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 MRPL50YNR022C 420 nt2.51□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 SAK1YER129W 3429 nt2.51□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 INP51YIL002C 2841 nt2.5□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 SPF1YEL031W 3648 nt2.5□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.5□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 RPL29YFR032C-A 180 nt2.5□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 ABM1YJR108W 372 nt2.5□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.5□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 snR13snR13 124 nt2.5□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 YPL080CYPL080C 327 nt2.5□□□□□ -2.01
YML002WP0CF17 SNF12YNR023W 1701 nt2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.6 ms