Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Garem1Q3UFT3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Garem1Q3UFT3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Garem1Q3UFT3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Garem1Q3UFT3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Garem1Q3UFT3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Garem1Q3UFT3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Garem1Q3UFT3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Garem1Q3UFT3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Garem1Q3UFT3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Garem1Q3UFT3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Garem1Q3UFT3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Garem1Q3UFT3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Garem1Q3UFT3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Garem1Q3UFT3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms