Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 YJL064WYJL064W 396 nt8□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 PAU19YMR325W 375 nt8□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 ERG13YML126C 1476 nt8□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 SPT20YOL148C 1815 nt7.99□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 CCT2YIL142W 1584 nt7.99□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 YOR325WYOR325W 474 nt7.99□□□□□ -1.13
PRP46Q12417 TVP23YDR084C 600 nt7.96□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 ADE8YDR408C 645 nt7.96□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 ILV2YMR108W 2064 nt7.96□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 LSB6YJL100W 1824 nt7.94□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 YJR114WYJR114W 393 nt7.94□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 ENT4YLL038C 744 nt7.94□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 CDD1YLR245C 429 nt7.94□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 AIM1YAL046C 357 nt7.93□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 SAC7YDR389W 1965 nt7.93□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 RFC1YOR217W 2586 nt7.92□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 OPI3YJR073C 621 nt7.92□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 ABZ2YMR289W 1125 nt7.91□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 RIM8YGL045W 1629 nt7.91□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 BET2YPR176C 978 nt7.9□□□□□ -1.14
PRP46Q12417 DIG1YPL049C 1359 nt7.89□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 IGD1YFR017C 588 nt7.89□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 RSC4YKR008W 1878 nt7.89□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 NAS2YIL007C 663 nt7.88□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 NPP1YCR026C 2229 nt7.88□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 THP3YPR045C 1413 nt7.86□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 TIM44YIL022W 1296 nt7.85□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 FSH2YMR222C 672 nt7.85□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 MUP1YGR055W 1725 nt7.85□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 YLR046CYLR046C 813 nt7.84□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 YNR064CYNR064C 873 nt7.84□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 SLG1YOR008C 1137 nt7.84□□□□□ -1.15
PRP46Q12417 ARO8YGL202W 1503 nt7.83□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 MET2YNL277W 1461 nt7.83□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 QDR2YIL121W 1629 nt7.82□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 HOL1YNR055C 1761 nt7.82□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 DLD3YEL071W 1491 nt7.81□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 PCP1YGR101W 1041 nt7.81□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 TIP1YBR067C 633 nt7.81□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 COQ8YGL119W 1506 nt7.81□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 AMF1YOR378W 1548 nt7.81□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 YGL114WYGL114W 2178 nt7.81□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.8□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 MAE1YKL029C 2010 nt7.79□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 SWT21YNL187W 1074 nt7.79□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 IPL1YPL209C 1104 nt7.79□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 KES1YPL145C 1305 nt7.78□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 ITR2YOL103W 1830 nt7.78□□□□□ -1.16
PRP46Q12417 FLX1YIL134W 936 nt7.77□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 SFP1YLR403W 2052 nt7.77□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 ZAP1YJL056C 2643 nt7.76□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 KRE1YNL322C 942 nt7.76□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 KEL3YPL263C 1956 nt7.76□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 SGA1YIL099W 1650 nt7.76□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 PHB2YGR231C 933 nt7.75□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 LEU2YCL018W 1095 nt7.75□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 ENO2YHR174W 1314 nt7.75□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 YHR219WYHR219W 1875 nt7.75□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 SFL1YOR140W 2301 nt7.74□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 YCP4YCR004C 744 nt7.74□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 TPC1YGR096W 945 nt7.74□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 ELO1YJL196C 933 nt7.74□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 ADH3YMR083W 1128 nt7.74□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 SPE2YOL052C 1191 nt7.74□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 GID8YMR135C 1368 nt7.73□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 VMA11YPL234C 495 nt7.73□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 SUV3YPL029W 2214 nt7.72□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 YMR265CYMR265C 1386 nt7.72□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 YCR025CYCR025C 411 nt7.72□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 SWM1YDR260C 513 nt7.72□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 YDR306CYDR306C 1437 nt7.71□□□□□ -1.17
PRP46Q12417 HAP5YOR358W 729 nt7.71□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 MRS6YOR370C 1812 nt7.69□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 NAM8YHR086W 1572 nt7.69□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 snR31snR31 225 nt7.69□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 UGP1YKL035W 1500 nt7.68□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 SDS24YBR214W 1584 nt7.68□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 ACO2YJL200C 2370 nt7.68□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 CWP2YKL096W-A 279 nt7.68□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 LSR1LSR1 1175 nt7.68□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 MET1YKR069W 1782 nt7.68□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 SAM50YNL026W 1455 nt7.68□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 RPN14YGL004C 1254 nt7.67□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 YKL133CYKL133C 1392 nt7.67□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 GAL2YLR081W 1725 nt7.66□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 YIA6YIL006W 1122 nt7.66□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 REX2YLR059C 810 nt7.66□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 RIB1YBL033C 1038 nt7.66□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 CRC1YOR100C 984 nt7.66□□□□□ -1.18
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