Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 RIM2YBR192W 1134 nt10.23□□□□□ -0.77
LSP1Q12230 RIB7YBR153W 735 nt10.22□□□□□ -0.77
LSP1Q12230 DPL1YDR294C 1770 nt10.21□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 GAL3YDR009W 1563 nt10.2□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 RIB2YOL066C 1776 nt10.2□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 LEU4YNL104C 1860 nt10.19□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 HXT12YIL170W 1374 nt10.19□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 ALD5YER073W 1563 nt10.18□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 HXK1YFR053C 1458 nt10.18□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 ADE8YDR408C 645 nt10.17□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 IMO32YGR031W 1029 nt10.17□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 TPO4YOR273C 1980 nt10.16□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 INH1YDL181W 258 nt10.16□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 YOR072WYOR072W 315 nt10.16□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 YNR064CYNR064C 873 nt10.15□□□□□ -0.78
LSP1Q12230 HMG2YLR450W 3138 nt10.15□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 RRT8YOL048C 1029 nt10.14□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 YMR265CYMR265C 1386 nt10.14□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 NBA1YOL070C 1506 nt10.13□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 YJR114WYJR114W 393 nt10.13□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 YMR226CYMR226C 804 nt10.13□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 KRR1YCL059C 951 nt10.12□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 YDR467CYDR467C 327 nt10.12□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 PCP1YGR101W 1041 nt10.11□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 HAP5YOR358W 729 nt10.1□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 NPP2YEL016C 1482 nt10.1□□□□□ -0.79
LSP1Q12230 YMR244WYMR244W 1068 nt10.08□□□□□ -0.8
LSP1Q12230 SUV3YPL029W 2214 nt10.08□□□□□ -0.8
LSP1Q12230 KEL3YPL263C 1956 nt10.07□□□□□ -0.8
LSP1Q12230 YPI1YFR003C 468 nt10.07□□□□□ -0.8
LSP1Q12230 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt10.07□□□□□ -0.8
LSP1Q12230 OPI3YJR073C 621 nt10.07□□□□□ -0.8
LSP1Q12230 RPN14YGL004C 1254 nt10.06□□□□□ -0.8
LSP1Q12230 ESBP6YNL125C 2022 nt10.04□□□□□ -0.8
LSP1Q12230 MEX67YPL169C 1800 nt10.03□□□□□ -0.8
LSP1Q12230 CRC1YOR100C 984 nt10.03□□□□□ -0.8
LSP1Q12230 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 URA8YJR103W 1737 nt10.02□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 DAK2YFL053W 1776 nt10.01□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 FET5YFL041W 1869 nt10□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 SFL1YOR140W 2301 nt9.99□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 ILV2YMR108W 2064 nt9.99□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 SNZ1YMR096W 894 nt9.99□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 YNR029CYNR029C 1290 nt9.99□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 MIM1YOL026C 342 nt9.98□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 MET1YKR069W 1782 nt9.98□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 TRP2YER090W 1524 nt9.97□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 MTO1YGL236C 2010 nt9.96□□□□□ -0.81
LSP1Q12230 TVP23YDR084C 600 nt9.96□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 GPM1YKL152C 744 nt9.96□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 snR31snR31 225 nt9.96□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 YBL095WYBL095W 813 nt9.94□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 KGD2YDR148C 1392 nt9.93□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 ENO2YHR174W 1314 nt9.93□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 RBG2YGR173W 1107 nt9.93□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 YKL053WYKL053W 375 nt9.93□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 SWT21YNL187W 1074 nt9.93□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 YMC2YBR104W 990 nt9.93□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 AAT1YKL106W 1356 nt9.92□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 SPS100YHR139C 981 nt9.92□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 THI6YPL214C 1623 nt9.92□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 ADH1YOL086C 1047 nt9.91□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 YPR126CYPR126C 309 nt9.91□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 EMC3YKL207W 762 nt9.9□□□□□ -0.82
LSP1Q12230 GTB1YDR221W 2109 nt9.89□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 DTR1YBR180W 1719 nt9.88□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 ABZ2YMR289W 1125 nt9.88□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 FRE6YLL051C 2139 nt9.88□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 IML3YBR107C 738 nt9.87□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 CTI6YPL181W 1521 nt9.87□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 THI3YDL080C 1830 nt9.86□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 AMF1YOR378W 1548 nt9.86□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 HXT11YOL156W 1704 nt9.85□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 GAL2YLR081W 1725 nt9.84□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 HBS1YKR084C 1836 nt9.84□□□□□ -0.83
LSP1Q12230 GGA2YHR108W 1758 nt9.83□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 ESS1YJR017C 513 nt9.83□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 SRM1YGL097W 1449 nt9.82□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 CCT5YJR064W 1689 nt9.82□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 BSP1YPR171W 1731 nt9.82□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 TPC1YGR096W 945 nt9.81□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 SBP1YHL034C 885 nt9.8□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 ORT1YOR130C 879 nt9.8□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 MDL2YPL270W 2322 nt9.8□□□□□ -0.84
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