Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 OPI3YJR073C 621 nt8.94□□□□□ -0.98
PUF2Q12221 PAU19YMR325W 375 nt8.94□□□□□ -0.98
PUF2Q12221 YJR114WYJR114W 393 nt8.93□□□□□ -0.98
PUF2Q12221 CMP2YML057W 1815 nt8.93□□□□□ -0.98
PUF2Q12221 MUP1YGR055W 1725 nt8.92□□□□□ -0.98
PUF2Q12221 TVP23YDR084C 600 nt8.92□□□□□ -0.98 RIP-Chip
PUF2Q12221 CDD1YLR245C 429 nt8.91□□□□□ -0.98
PUF2Q12221 ABZ2YMR289W 1125 nt8.91□□□□□ -0.98
PUF2Q12221 NAS2YIL007C 663 nt8.9□□□□□ -0.98
PUF2Q12221 ARO8YGL202W 1503 nt8.9□□□□□ -0.99
PUF2Q12221 QDR2YIL121W 1629 nt8.89□□□□□ -0.99
PUF2Q12221 HSL7YBR133C 2484 nt8.88□□□□□ -0.99
PUF2Q12221 DIG1YPL049C 1359 nt8.87□□□□□ -0.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 IGD1YFR017C 588 nt8.87□□□□□ -0.99
PUF2Q12221 ENT4YLL038C 744 nt8.87□□□□□ -0.99
PUF2Q12221 HOL1YNR055C 1761 nt8.86□□□□□ -0.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR046CYLR046C 813 nt8.86□□□□□ -0.99
PUF2Q12221 YNR064CYNR064C 873 nt8.84□□□□□ -0.99
PUF2Q12221 SLG1YOR008C 1137 nt8.84□□□□□ -0.99
PUF2Q12221 ITR2YOL103W 1830 nt8.83□□□□□ -1
PUF2Q12221 ELO1YJL196C 933 nt8.83□□□□□ -1
PUF2Q12221 KRE1YNL322C 942 nt8.83□□□□□ -1
PUF2Q12221 SPE2YOL052C 1191 nt8.83□□□□□ -1
PUF2Q12221 TIP1YBR067C 633 nt8.83□□□□□ -1
PUF2Q12221 COQ8YGL119W 1506 nt8.83□□□□□ -1
PUF2Q12221 KES1YPL145C 1305 nt8.82□□□□□ -1
PUF2Q12221 GID8YMR135C 1368 nt8.81□□□□□ -1
PUF2Q12221 DLD3YEL071W 1491 nt8.81□□□□□ -1
PUF2Q12221 ENO2YHR174W 1314 nt8.8□□□□□ -1
PUF2Q12221 TPC1YGR096W 945 nt8.8□□□□□ -1
PUF2Q12221 AMF1YOR378W 1548 nt8.79□□□□□ -1
PUF2Q12221 THP3YPR045C 1413 nt8.79□□□□□ -1 RIP-Chip
PUF2Q12221 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 PCP1YGR101W 1041 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 YHR219WYHR219W 1875 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 SGA1YIL099W 1650 nt8.78□□□□□ -1
PUF2Q12221 MRS6YOR370C 1812 nt8.77□□□□□ -1
PUF2Q12221 GID7YCL039W 2238 nt8.77□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 SFL1YOR140W 2301 nt8.77□□□□□ -1.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 HEL2YDR266C 1920 nt8.76□□□□□ -1.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 LSR1LSR1 1175 nt8.76□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 ZAP1YJL056C 2643 nt8.75□□□□□ -1.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 PHB2YGR231C 933 nt8.75□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 ADH3YMR083W 1128 nt8.75□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 IPL1YPL209C 1104 nt8.75□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 SWT21YNL187W 1074 nt8.74□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 YKL133CYKL133C 1392 nt8.73□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 SUV3YPL029W 2214 nt8.73□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 KEL3YPL263C 1956 nt8.73□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 MET2YNL277W 1461 nt8.72□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 TIM44YIL022W 1296 nt8.72□□□□□ -1.01
PUF2Q12221 FLX1YIL134W 936 nt8.71□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 MET1YKR069W 1782 nt8.71□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 UGP1YKL035W 1500 nt8.7□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 NAM8YHR086W 1572 nt8.7□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 FSH2YMR222C 672 nt8.7□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 SFP1YLR403W 2052 nt8.69□□□□□ -1.02 RIP-Chip
PUF2Q12221 YCR025CYCR025C 411 nt8.69□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 LEU2YCL018W 1095 nt8.69□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 NPP1YCR026C 2229 nt8.68□□□□□ -1.02 RIP-Chip
PUF2Q12221 YKR012CYKR012C 378 nt8.68□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 VMA11YPL234C 495 nt8.68□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 YMR265CYMR265C 1386 nt8.68□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 YKL053WYKL053W 375 nt8.67□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 HAP5YOR358W 729 nt8.67□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 MOB1YIL106W 945 nt8.66□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 CRC1YOR100C 984 nt8.66□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 LYS20YDL182W 1287 nt8.65□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 ACO2YJL200C 2370 nt8.65□□□□□ -1.02
PUF2Q12221 BSP1YPR171W 1731 nt8.64□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 SAM50YNL026W 1455 nt8.64□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 SDS24YBR214W 1584 nt8.62□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 YCP4YCR004C 744 nt8.62□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 SNX3YOR357C 489 nt8.62□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 RPD3YNL330C 1302 nt8.61□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 HIS2YFR025C 1008 nt8.61□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 REX2YLR059C 810 nt8.61□□□□□ -1.03 RIP-Chip
PUF2Q12221 SSL2YIL143C 2532 nt8.6□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 SWM1YDR260C 513 nt8.6□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 snR31snR31 225 nt8.6□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 RIM2YBR192W 1134 nt8.6□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 VBA3YCL069W 1377 nt8.59□□□□□ -1.03
PUF2Q12221 SRP54YPR088C 1626 nt8.58□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 RPN14YGL004C 1254 nt8.58□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 SAN1YDR143C 1833 nt8.58□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 SER2YGR208W 930 nt8.57□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 CYC3YAL039C 810 nt8.57□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 KGD2YDR148C 1392 nt8.57□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 ODC1YPL134C 933 nt8.55□□□□□ -1.04
PUF2Q12221 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.54□□□□□ -1.04
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