Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dll3O88516 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dll3O88516 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dll3O88516 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dll3O88516 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Dll3O88516 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dll3O88516 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dll3O88516 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dll3O88516 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dll3O88516 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dll3O88516 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dll3O88516 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dll3O88516 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dll3O88516 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms