Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dll3O88516 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dll3O88516 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dll3O88516 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dll3O88516 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dll3O88516 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Dll3O88516 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dll3O88516 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dll3O88516 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dll3O88516 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dll3O88516 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dll3O88516 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dll3O88516 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dll3O88516 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dll3O88516 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dll3O88516 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dll3O88516 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dll3O88516 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dll3O88516 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dll3O88516 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dll3O88516 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dll3O88516 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms