Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Mbd5B1AYB6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Mbd5B1AYB6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Mbd5B1AYB6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Mbd5B1AYB6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Mbd5B1AYB6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Mbd5B1AYB6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Mbd5B1AYB6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Mbd5B1AYB6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Mbd5B1AYB6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Mbd5B1AYB6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Mbd5B1AYB6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Mbd5B1AYB6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Mbd5B1AYB6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Mbd5B1AYB6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Mbd5B1AYB6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Mbd5B1AYB6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Mbd5B1AYB6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Mbd5B1AYB6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Mbd5B1AYB6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Mbd5B1AYB6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Mbd5B1AYB6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Mbd5B1AYB6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Mbd5B1AYB6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Mbd5B1AYB6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Mbd5B1AYB6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Mbd5B1AYB6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Mbd5B1AYB6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Mbd5B1AYB6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Mbd5B1AYB6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Mbd5B1AYB6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Mbd5B1AYB6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Mbd5B1AYB6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Mbd5B1AYB6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Mbd5B1AYB6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Mbd5B1AYB6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Mbd5B1AYB6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Mbd5B1AYB6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Mbd5B1AYB6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Mbd5B1AYB6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Mbd5B1AYB6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Mbd5B1AYB6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Mbd5B1AYB6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Mbd5B1AYB6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Mbd5B1AYB6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Mbd5B1AYB6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Mbd5B1AYB6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Mbd5B1AYB6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Mbd5B1AYB6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms