Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TAF1CQ15572 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF1CQ15572 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms