Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 HHT2YNL031C 411 nt2.78□□□□□ -1.96 RIP-Chip
PUF2Q12221 HSP10YOR020C 321 nt2.78□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 HEM4YOR278W 828 nt2.78□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 DYN1YKR054C 12279 nt2.78□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 TFC4YGR047C 3078 nt2.78□□□□□ -1.96
PUF2Q12221 TAO3YIL129C 7131 nt2.78□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 FRE2YKL220C 2136 nt2.77□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 ROY1YMR258C 1662 nt2.77□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 TAF2YCR042C 4224 nt2.77□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 RNR4YGR180C 1038 nt2.77□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.77□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 ICY1YMR195W 384 nt2.77□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.77□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 FYV4YHR059W 393 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YKR033CYKR033C 426 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 SIP18YMR175W 240 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YNL043CYNL043C 321 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YAF9YNL107W 681 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YPR014CYPR014C 330 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YPR039WYPR039W 336 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 VHR2YER064C 1518 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 RSN1YMR266W 2862 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 SLN1YIL147C 3663 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 PUF6YDR496C 1971 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YHR078WYHR078W 1659 nt2.76□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 PRP8YHR165C 7242 nt2.75□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 BIT61YJL058C 1632 nt2.75□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 IKI3YLR384C 4050 nt2.75□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 NET1YJL076W 3570 nt2.75□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YHL037CYHL037C 402 nt2.75□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt2.75□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 URA10YMR271C 684 nt2.75□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YPL080CYPL080C 327 nt2.75□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YGR067CYGR067C 2415 nt2.75□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 DSE4YNR067C 3354 nt2.74□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 PAU23YLR037C 375 nt2.74□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 LSM2YBL026W 288 nt2.74□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 NMA111YNL123W 2994 nt2.74□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 MKT1YNL085W 2493 nt2.74□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YPP1YGR198W 2454 nt2.73□□□□□ -1.97 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDL068WYDL068W 330 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YDL152WYDL152W 366 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 RPL29YFR032C-A 180 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YGR025WYGR025W 303 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.73□□□□□ -1.97 RIP-Chip
PUF2Q12221 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YIL054WYIL054W 318 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 RPS22AYJL190C 393 nt2.73□□□□□ -1.97 RIP-Chip
PUF2Q12221 PHD1YKL043W 1101 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YAR068WYAR068W 486 nt2.73□□□□□ -1.97 RIP-Chip
PUF2Q12221 snR13snR13 124 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 TFB1YDR311W 1929 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 DNA2YHR164C 4569 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 NIC96YFR002W 2520 nt2.73□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 BPT1YLL015W 4680 nt2.72□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.72□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YAR053WYAR053W 297 nt2.72□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 VTI1YMR197C 654 nt2.72□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 DGK1YOR311C 873 nt2.72□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 YPL039WYPL039W 951 nt2.72□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 AXL1YPR122W 3627 nt2.72□□□□□ -1.97
PUF2Q12221 DIE2YGR227W 1578 nt2.71□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 TRZ1YKR079C 2517 nt2.71□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 NHP2YDL208W 471 nt2.71□□□□□ -1.98 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPB11YOL005C 363 nt2.71□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YOR146WYOR146W 306 nt2.71□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 snR191snR191 274 nt2.71□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 BOI1YBL085W 2943 nt2.71□□□□□ -1.98 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATP17YDR377W 306 nt2.7□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 ERG28YER044C 447 nt2.7□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YER097WYER097W 330 nt2.7□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 NSL1YPL233W 651 nt2.7□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 SLM6YBR266C 453 nt2.7□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 MES1YGR264C 2256 nt2.7□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YJR003CYJR003C 1560 nt2.7□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 PSY2YNL201C 2577 nt2.69□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YLR278CYLR278C 4026 nt2.69□□□□□ -1.98 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDR413CYDR413C 576 nt2.69□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 RAD6YGL058W 519 nt2.69□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YOR282WYOR282W 321 nt2.69□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 KIN82YCR091W 2163 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 RGR1YLR071C 3249 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YLR001CYLR001C 2589 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 SEC7YDR170C 6030 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 snR65snR65 100 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 BAT1YHR208W 1182 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 PET191YJR034W 327 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 RPS7BYNL096C 573 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 ATP3YBR039W 936 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 SNQ2YDR011W 4506 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 MDM32YOR147W 1869 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 SNF12YNR023W 1701 nt2.68□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 SPC72YAL047C 1869 nt2.67□□□□□ -1.98
PUF2Q12221 NAB3YPL190C 2409 nt2.67□□□□□ -1.98
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