Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC24CP53992 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC24CP53992 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms