Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARID3CA6NKF2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ARID3CA6NKF2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
ARID3CA6NKF2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms