Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
MCF2L2Q86YR7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCF2L2Q86YR7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms