Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
J3KRW8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
J3KRW8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
J3KRW8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3KRW8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3KRW8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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