Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TAF1CQ15572 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TAF1CQ15572 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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