Protein–RNA interactions for Protein: Q12342

LDB17, Protein LDB17, yeastyeast

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LDB17Q12342 PET191YJR034W 327 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 YMR187CYMR187C 1296 nt2.34□□□□□ -2.03
LDB17Q12342 SGS1YMR190C 4344 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 COG3YER157W 2406 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 PSK2YOL045W 3306 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 TMA20YER007C-A 546 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 BUD19YJL188C 309 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YLR257WYLR257W 966 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 RPL36AYMR194W 303 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 MBA1YBR185C 837 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YOL098CYOL098C 3114 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 SCP160YJL080C 3669 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 RLF2YPR018W 1821 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 ALY1YKR021W 2748 nt2.33□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 HRD3YLR207W 2502 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 VPS13YLL040C 9435 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 TIM9YEL020W-A 264 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 THG1YGR024C 714 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YGR053CYGR053C 852 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YMR320WYMR320W 306 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 SGT1YOR057W 1188 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 ARF3YOR094W 552 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 NUP100YKL068W 2880 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 NAB6YML117W 3405 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 VPS41YDR080W 2979 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 TPS2YDR074W 2691 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 INP51YIL002C 2841 nt2.32□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 SHS1YDL225W 1656 nt2.31□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 NCB2YDR397C 441 nt2.31□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 PAU14YIL176C 363 nt2.31□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 PAU1YJL223C 363 nt2.31□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 RNP1YLL046C 750 nt2.31□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 PEX17YNL214W 600 nt2.31□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 DNF1YER166W 4716 nt2.31□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 RGA2YDR379W 3030 nt2.31□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 SIP3YNL257C 3690 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 DAD1YDR016C 285 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 TWF1YGR080W 999 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 SDL1YIL167W 633 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 VPH2YKL119C 648 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 ECM9YKR004C 1134 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 RPL16BYNL069C 597 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 RRT16YNL105W 429 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YOR283WYOR283W 693 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YBR062CYBR062C 543 nt2.3□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 HSC82YMR186W 2118 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 RPN3YER021W 1572 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YDR018CYDR018C 1191 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YER189WYER189W 369 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 FAR7YFR008W 666 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 ACF4YJR083C 930 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 AIM32YML050W 936 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 RPS16AYMR143W 432 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 PAI3YMR174C 207 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 GIM3YNL153C 390 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 ALG14YBR070C 714 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 DAD3YBR233W-A 285 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YPK1YKL126W 2043 nt2.29□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 PCK1YKR097W 1650 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 APL5YPL195W 2799 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 BAS1YKR099W 2436 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 CTF13YMR094W 1437 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 BFR1YOR198C 1413 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YDR029WYDR029W 315 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 TDA2YER071C 381 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 AAD16YFL057C 459 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 RGM1YMR182C 636 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YOL029CYOL029C 606 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 DGK1YOR311C 873 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YPR097WYPR097W 3222 nt2.28□□□□□ -2.04
LDB17Q12342 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 snR59snR59 78 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 snR9snR9 187 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 OCA6YDR067C 675 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 PRP38YGR075C 729 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 SRP21YKL122C 504 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 PAU23YLR037C 375 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YLR224WYLR224W 1110 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 COX8YLR395C 237 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 PDP3YLR455W 915 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 CLN3YAL040C 1743 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 GPI17YDR434W 1605 nt2.27□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 TFC3YAL001C 3483 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 MFB1YDR219C 1398 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 TOF1YNL273W 3717 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 NPR1YNL183C 2373 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YDL016CYDL016C 303 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YGR226CYGR226C 210 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 CKA1YIL035C 1119 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 UTP30YKR060W 825 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 YNR021WYNR021W 1215 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 RBL2YOR265W 321 nt2.26□□□□□ -2.05
LDB17Q12342 INP53YOR109W 3324 nt2.26□□□□□ -2.05
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