Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YKL044WYKL044W 321 nt2.68□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YHC1YLR298C 696 nt2.68□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YNL122CYNL122C 348 nt2.68□□□□□ -1.98
SEF1P34228 CHS2YBR038W 2892 nt2.68□□□□□ -1.98
SEF1P34228 FLO11YIR019C 4104 nt2.68□□□□□ -1.98
SEF1P34228 UBP14YBR058C 2346 nt2.68□□□□□ -1.98
SEF1P34228 MOT1YPL082C 5604 nt2.67□□□□□ -1.98
SEF1P34228 AHC2YCR082W 387 nt2.67□□□□□ -1.98
SEF1P34228 AST2YER101C 1293 nt2.67□□□□□ -1.98
SEF1P34228 PRE4YFR050C 801 nt2.67□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YGR045CYGR045C 363 nt2.67□□□□□ -1.98
SEF1P34228 TIM10YHR005C-A 282 nt2.67□□□□□ -1.98
SEF1P34228 TOA1YOR194C 861 nt2.67□□□□□ -1.98
SEF1P34228 NPR1YNL183C 2373 nt2.67□□□□□ -1.98
SEF1P34228 KIN82YCR091W 2163 nt2.67□□□□□ -1.98
SEF1P34228 ECM21YBL101C 3354 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 HNT1YDL125C 477 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 TIF35YDR429C 825 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YHL005CYHL005C 393 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 TMA10YLR327C 261 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 LSM2YBL026W 288 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 MRPL44YMR225C 297 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 ESF2YNR054C 951 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 HEH2YDR458C 1992 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.66□□□□□ -1.98
SEF1P34228 SHE9YDR393W 1371 nt2.65□□□□□ -1.98
SEF1P34228 GCV2YMR189W 3105 nt2.65□□□□□ -1.98
SEF1P34228 ADK1YDR226W 669 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YER038W-AYER038W-A 381 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RPL29YFR032C-A 180 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RPL9AYGL147C 576 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 NOP19YGR251W 591 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RPL6AYML073C 531 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YNL046WYNL046W 519 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 ISU1YPL135W 498 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 SVS1YPL163C 783 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 NSL1YPL233W 651 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 GEA1YJR031C 4227 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 SAP1YER047C 2694 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 PUF4YGL014W 2667 nt2.65□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RPS17BYDR447C 411 nt2.64□□□□□ -1.99
SEF1P34228 ARV1YLR242C 966 nt2.64□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.64□□□□□ -1.99
SEF1P34228 NMD2YHR077C 3270 nt2.64□□□□□ -1.99
SEF1P34228 SLH1YGR271W 5904 nt2.64□□□□□ -1.99
SEF1P34228 GCD10YNL062C 1437 nt2.63□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RGL1YPL066W 1440 nt2.63□□□□□ -1.99
SEF1P34228 snR70snR70 164 nt2.63□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RAD6YGL058W 519 nt2.63□□□□□ -1.99
SEF1P34228 PET123YOR158W 957 nt2.63□□□□□ -1.99
SEF1P34228 BPT1YLL015W 4680 nt2.63□□□□□ -1.99
SEF1P34228 ESL1YIL151C 3357 nt2.63□□□□□ -1.99
SEF1P34228 MDM1YML104C 3384 nt2.63□□□□□ -1.99
SEF1P34228 SUL1YBR294W 2580 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YIL166CYIL166C 1629 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YCR108CYCR108C 192 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 TSA2YDR453C 591 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RTS3YGR161C 792 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 SYS1YJL004C 612 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 SDH3YKL141W 597 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 FYV7YLR068W 456 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 SWM2YNR004W 441 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 COQ10YOL008W 624 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 ATG13YPR185W 2217 nt2.62□□□□□ -1.99
SEF1P34228 VPS64YDR200C 1815 nt2.61□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YDR209CYDR209C 414 nt2.61□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.61□□□□□ -1.99
SEF1P34228 LAG1YHL003C 1236 nt2.61□□□□□ -1.99
SEF1P34228 SMA2YML066C 1110 nt2.61□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.61□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YPL080CYPL080C 327 nt2.61□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YPL276WYPL276W 438 nt2.61□□□□□ -1.99
SEF1P34228 IKI3YLR384C 4050 nt2.61□□□□□ -1.99
SEF1P34228 DNL4YOR005C 2835 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 GCD6YDR211W 2139 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YDR220CYDR220C 294 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 GLC7YER133W 939 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YER189WYER189W 369 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YAP3YHL009C 993 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RPL16AYIL133C 600 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RGM1YMR182C 636 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 FPR1YNL135C 345 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 LCL1YPL056C 306 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YBR209WYBR209W 318 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 SKT5YBL061C 2091 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YNL034WYNL034W 1839 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 ILS1YBL076C 3219 nt2.6□□□□□ -1.99
SEF1P34228 PMR1YGL167C 2853 nt2.59□□□□□ -1.99
SEF1P34228 GYP7YDL234C 2241 nt2.59□□□□□ -1.99
SEF1P34228 snR76snR76 109 nt2.59□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RTR2YDR066C 591 nt2.59□□□□□ -1.99
SEF1P34228 MXR1YER042W 555 nt2.59□□□□□ -1.99
SEF1P34228 RPF1YHR088W 888 nt2.59□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YOL134CYOL134C 390 nt2.59□□□□□ -1.99
SEF1P34228 YPR050CYPR050C 414 nt2.59□□□□□ -1.99
SEF1P34228 GPI17YDR434W 1605 nt2.59□□□□□ -1.99
SEF1P34228 DNA2YHR164C 4569 nt2.58□□□□□ -2
SEF1P34228 TPS2YDR074W 2691 nt2.58□□□□□ -2
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