Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC4BQ9NT99 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC4BQ9NT99 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms